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Primo anno |
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Sperimentazione animale - Docenti afferenti all'OPBA |
20 |
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La protezione e il benessere degli animali sono tutelati da provvedimenti legislativi emanati dell'Unione Europea e recepiti dalle normative Nazionali vigenti. Il corso si propone di far acquisire una conoscenza approfondita della legislazione Nazionale ed Europea vigente in materia di protezione degli animali utilizzati ai fini scientifici; acquisizione delle conoscenze e delle competenze scientifiche in materia di allevamento e cura degli animali utilizzabili per scopi di ricerca. |
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Short course on ADME-physiochemical properties of Drugs-PK - Dr. Franco Lombardo |
10 |
6 e 7 giugno 2-2.5 ore mattina e 2-2,5 ore pomeriggio, |
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This 10-hours short course will cover all aspects ofdrugs ADME ranging from in silico, in vitro and in vivo methods to study Absorption, Distribution, Metabolism and Excretion, with reference to thè physiological and physicochemical bases underlying thè pharmacokinetics of drugs. Great emphasis will be placed on physicochemical properties ofdrugs and structure properties relationships (QSPRs). Recent examples from literature on thè impact of physicochemical properties on ADME and pharmacokinetics (PK) will be presented. Pharmacokinetics calculations, with reference to human PK and dose prediction will be covered in all sections
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Chimica Organica Avanzata - Giorgio Giorgi |
4 |
19 al 22 febbraio, di mattina.
Farei almeno 5 ore, dal lunedì al giovedì, 1 ora lunedì e giovedì e un'ora e mezza martedì e mercoledì. |
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: Impiego della RMN nella determinazione strutturale, nell'assegnazione dei composti organico e nella determinazione della configurazione relativa di composti organici. Chimica dei radicali. Induzioni asimmetriche. Regole di Baldwin. Reazioni di metatesi. |
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Ricerca bibliografica e scrittura accademica - Maria Squarcione |
8 |
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Evaluate the quality of information: Web of Science, Scopus, google scholar, bibliometrics, altmetrics, Make effective use of information: the publication cycle, scientific communication, open science. Apply information: open access, gold and green road, hybrid open access |
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Chemical biology, an approach to solve biological questions and speed up drug discovery - Francesco Saccoliti |
12 |
settembre-ottobre |
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Chemistry, structure and function of key biomolecules; Molecular interactions in biological systems; Analytical and biochemical techniques in chemical biology; Bioorthogonal chemistry; Chemical manipulation and labeling of biomolecules; Activity-based probes; Affinity-based probes; Fluorescent probes and bioimaging; Modulators and degraders; Antibody-drug conjugates (ADC). |
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Biosafety in the research Lab - personale INAIL, Prof. Cutruzzolà |
6 |
aprile/maggio 2024 |
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Secondo anno |
Ore |
Data |
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Abstract |
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Epidemiologia e biostatistica di base - Corrado De Vito, Paolo Villari, Carolina Marzuillo |
4 |
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Concetti base dell'epidemiologia delle malattie trasmissibili |
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The New Version of The Human Genome: Concepts and Practical Application - Viviana Caputo |
4 |
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Verranno presentate le tecniche di sequenziamento che hanno permesso di assemblare l’ultima versione del genoma umano, T2T-CHM13, e verranno inoltre mostrati alcuni esempi pratici di strutture geniche o regioni genomiche che sono state completate e risolte in questa ultima versione. I partecipanti acquisiranno conoscenze di base per il confronto di diverse versioni del genoma umano, mediante l’utilizzo del genome browser UCSC. |
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Advanced biomedical technologies - Nicole Zoratto |
4 |
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Explore thè fundamentals oftissue engineering, covering key elements such as cells, matrix, active molecules, and environmental factors. - Delve into thè biomaterials used in tissue engineering, emphasizing scaffold design principles. - Understand scaffold fabrication techniques, their characterization, and thè practical application of tissue engineering, including current challenges. 3D Printing in Medicine and Tissue Engineering (Duration: 2 hours) - Introduce thè concept of personalized medicine and its intersection with 3D printing technologies. - Explore advanced 3D printing techniques such as inject printing, fused deposition modeling (FDM), and digitai tight processing (DLP) and stereolithography (SLA) printing. - Investigate thè applications of 3D printing in drug delivery and tissue engineering, highlighting its potential in revolutionizing healthcare. Nanoparticles (Duration: 2 hours) - Provide an overview of nanoparticles utilized in drug delivery from polymeric and lipidic nanoparticles to extracellular vesicles (exosomes). - Explore thè isolation methods and drug loading technologies for extracellular vesicles. - Explore thè techniques employed in nanoparticle formation and characterization. - Applications of nanoparticles in drug delivery, emphasizing thè rote oflipid nanoparticles in thè development ofthe SARS-CoV-2 mRNA vaccine. Microfluidics (Duration: 2 hours) - Introduce fluid dynamics for microfluidics (behaviors offluids at thè microscale). - Explore thè different types of chips used in nanoparticle and microparticle fabrication. - Applications of microfluidics in both drug delivery and tissue engineering |
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Statistics for biologists - modulo I "Theory classes” - Mario Fordellone (ex-cathedra) aprile/maggio 2024 |
8 |
aprile/maggio |
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L'obiettivo è quello di fornire ai dottorandi le nozioni dei metodi statistici di base applicabili alla ricerca scientifica. Programma: - Introduction theory for point estimation, confidence interval, and hypothesis testing, Statistical significance, and p-value. - Tests on normal populations, the case of one sample, two independent samples, two paired samples, more than two samples, post-hoc tests. - Normality hypothesis testing, tests on non-normal populations, the case of two independent samples, two paired samples, more than two samples, post-hoc tests. - Nonparametric statistics - Adjusting for multiple testing - Basic theory on survival analysis. |
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Statistics for biologists - Modulo II: “Practice sessions” - Valerio Licursi (laboratorio) aprile/maggio 2024 |
8 |
aprile/maggio |
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Il corso è rivolto agli studenti del secondo anno della Scuola di Dottorato in Biologia e Medicina Molecolare ed è organizzato dal corso di Dottorato in Biologia Cellulare e dello Sviluppo. L'obiettivo è quello di fornire ai dottorandi le nozioni dei metodi statistici di base applicabili alla ricerca scientifica, consentendo con la parte pratica di familiarizzare con i principali pacchetti di software disponibili in rete. Programma: - Intro to R and RStudio - Basic R syntax and data structure: access to elements (vectors, lists, dataframes) - Data handling and visualisation - explore and manipulate data in R with tidyverse - use the R package ggplot2 to visualize data and create plots - Hands-on: statistical tests with R on real data |
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Ligand binding and enzyme kinetics - Prof. Andrea Bellelli (Dept. of Biochemical Sciences, Sapienza University of Rome; Prof. Roberto Contestabile, Dept. of Biochemical Sciences, Sapienza University of Rome); Dr. Alessandro Giuffrè, Institute of Molecular Biology and Pathology, CNR - secondo semestre 2024 |
12 |
secondo semestre |
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Il corso è organizzato dal dottorato in BIOCHIMICA e aperto alle attività formative della scuola BeMM. The focus of this course is to train 2nd PhD students to the quantitative approaches for studying ligand binding and enzyme kinetics. The goal of this short Course is to introduce cell biology, biotechnology, molecular biology, chemistry and biochemistry Students to the kinetics of ligand binding processes and enzyme-catalyzed reactions, and to cover in detail the assumptions, derivation, and meaning of the Michaelis–Menten equation within a biological context. Special emphasis will also be given on the practical aspects, including the experimental design, and its biological relevance as detailed by specific examples. In detail: Basic principles of enzyme kinetics ❖ Pseudo-first order conditions ❖ Practical aspects of enzyme kinetics (experimental design) ❖ Derivation of steady-state rate equations ❖ Multi-substrate enzymes. Basic principles of ligand binding ❖ Practical aspects (experimental design) ❖ Pre steady-state kinetics ❖ SVD data analysis. Enzyme inhibition and activation ❖ Types of inhibition ❖ Complex inhibition systems. Examples from the literature. |
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Terzo anno |
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Abstract |
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Proprietà intellettuale nel settore chimico e biotecnologico - Paola Pace |
6 |
fine aprile |
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Approfondimenti sulle peculiarità della brevettazione nel settore chimico-farmaceutico - certificati complementari SPC/CCP: evoluzione
normativa e protezione conferita; - licenze obbligatorie - direttiva sulle biotecnologie: evoluzione e recenti cambiamenti - brevettazione nel settore biotech - varietà
vegetali Tecnica ed esercitazioni di claim drafting nel settore chimico farmaceutico Stesura di domanda di brevetto per invenzione in campo chimico-farmaceutico
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Alternative career in science - Associazione Giovanile Laboratorio 11 |
2 |
mag-24 |
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Il corso ha la funzione di ampliare il panorama degli sbocchi professionali per i dottorandi, mettendoli in comunicazione con diverse realtà lavorative. Il corso verrà svolto con la partecipazione dell'associazione "Inside-out” di giovani post-doc in Sapienza. |
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Public speaking - Settembre 2024 |
4 |
set-24 |
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In questo corso si vogliono fornire ai dottorandi le basi di come ci si confronta coi giornalisti e coi mezzi di comunicazione di massa: che cosa cercano, chi sono i pubblici, come si possono raggiungere nel modo migliore, senza equivoci, senza conflitti, e magari con reciproca soddisfazione. Teoria e pratica dell’intervista: dalla carta stampata, alla radio, alla tv.
Ma anche alcuni suggerimenti di scrittura e di comunicazione dal vivo per chi vuole fare da sé, senza troppi mediatori.
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Preparing Artwork for Scientific Papers - Prof. Giorgio Giardina, Prof. Gianni Stefano |
8 |
10 e 17 marzo 2024 |
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Corso organizzato dal dottorato in BIOCHIMICA e aperto alle attività formative della scuola BeMM. The course aims at giving the students a basic knowledge of the software and tools used to produce publication quality artwork for scientific papers, posters or presentations. A section on scientific writing is also part of the course. Programme: The course will cover the basic knowledge of graphic design such as: image resolution; vector vs raster images; colour theory and colour spaces (RGB, CMYK); basic rules for a good figure design. The students will then be introduced to the professional open-source graphic software for photo editing (GIMP) and vector-graphics (Inkscape). Finally, the entire workflow on how to write and plan the figures of a scientific paper will be covered. Expected outcomes: at the end of the course students will be able to 1. design and create a multi-panel image from scratch. This includes the ability to: modify source images, including legends and diagrams; export data and plots as image files; organize the layout and assemble the figure 2. prepare scientific figures and illustration in agreement with editorial artwork-guidelines using the main tools (from the main palette) of Open Source software such as GIMP, Inkscape, for raster and vector image modification 3. design and export images in the correct format, with image properties optimized for a specific communication media (e.g. scientific paper, research project, oral presentations, poster) 4. Organize the text of a manuscript according to good storytelling rules. |
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Biophysical Sciences: Nanomedicine - Giulio Caracciolo |
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Structure-activity relationship of nanomaterials for drug & gene delivery. Part 1 Structure-activity relationship of nanomaterials for drug & gene delivery. Part 2 New paradigms in applied biophysics: The nanoparticle-protein corona. Exploiting the nanoparticle-protein corona for targeted therapeutics. Converting the nanoparticle-protein corona into high-throughput diagnostic tests. |