Offerta formativa anno accademico 2026/2027


Elenco delle attività formative previste per i dottorandi del primo anno
Microscopia e analisi di immagini
data presunta: a.a. 2026-2027 - tipologia: riconducibile al progetto formativo - modalità di erogazione: laboratorio - numero ore: 4
docente del corso: Giulia Guarguaglini qualifica: Studioso o esperto di enti di ricerca affiliazione: Italiana
programma delle attività: Il Corso è organizzato dal dottorato in Genetica e Biologia Molecolare e aperto alle attività formative della scuola BeMM. Il corso teorico-pratico oltre a fornire le basi teoriche della microscopia prevede una parte pratica in cui i dottorandə potranno utilizzare la strumentazione per analizzare i propri preparati.
modalità di accertamento finale: Test valutativo
Sicurezza in laboratorio
data presunta: a.a. 2026-27 - tipologia: riconducibile al progetto formativo - modalità di erogazione: Ex-cathedra - numero ore: 7
docente del corso: Elena Sturchio (INAIL) Priscilla Boccia (INAIL) Miriam Zanellato (INAIL) Francesca Cutruzzolà (Sapienza) qualifica: Studioso o esperto di enti di ricerca affiliazione: Italiana
programma delle attività: Il Corso è organizzato dalla Scuola di Dottorato BeMM ed è un corso TEORICO-PRATICO. Il Corso intende creare maggiore consapevolezza sulle problematiche attinenti al settore delle biotecnologie; aggiornare e rendere più rigorosa la valutazione del rischio ambientale e della salute dell’uomo, motivando alla cultura della prevenzione. Il personale che lavora nei laboratori di ricerca è esposto ad un rischio professionale a volte sottovalutato dai diretti interessati, i quali percepiscono l’esistenza di tale rischio solo in caso di incidente. Per la riduzione del rischio di esposizione risulta quindi di fondamentale importanza la professionalità, l’addestramento, l’esperienza ed il buon senso dell’operatore. Tale attività formativa rappresenta uno dei risultati del Progetto di Ricerca Scientifica Inail: “Prevenzione e tutela della salute e dell’ambiente nei laboratori che utilizzano metodiche biotecnologiche avanzate ed innovative”, finalizzato proprio alla formazione e sensibilizzazione del personale universitario in modo da assicurare il rispetto del D.lgs.206/2001, con una metodologia caratterizzata dalla stretta sinergia tra studenti/ricercatori/Professori universitari/dirigenti.
modalità di accertamento finale: Test valutativo
Seminari dal ciclo Progressi nel campo della Biologia Molecolare
data presunta: a.a. 2026-27 - tipologia: riconducibile al progetto formativo - modalità di erogazione: Ex-cathedra - numero ore: 10
docente del corso: qualifica: Professore affiliazione: Italiana
programma delle attività: Seminari organizzati dal Dottorato in Genetica e Biologia Molecolare
modalità di accertamento finale:
Seminari dal ciclo Progressi nel campo della Genetica
data presunta: a.a. 2026-27 - tipologia: riconducibile al progetto formativo - modalità di erogazione: Ex-cathedra - numero ore: 10
docente del corso: qualifica: Professore affiliazione: Italiana
programma delle attività: Seminari organizzati dal Dottorato in Genetica e Biologia Molecolare
modalità di accertamento finale:
Sistemi modello in biologia - modulo 1: Il lievito
data presunta: 2026.2027 - tipologia: riconducibile al progetto formativo - modalità di erogazione: Ex-cathedra - numero ore: 8
docente del corso: Arianna Montanari qualifica: Ricercatore affiliazione: Italiana
programma delle attività: Il corso organizzato dalla Scuola BeMM illustra alcuni importanti sistemi modello eucariotici e ne presenta caratteristiche, aspetti metodologici ed applicazioni nel campo della biologia. Il corso è diviso in moduli monotematici; ogni modulo comprende 4 ore di teoria e 4 ore di pratica. Il primo modulo è dedicato ai lieviti.
modalità di accertamento finale: Test valutativo
Sistemi modello in biologia - modulo 2: C. elegans
data presunta: 2026.2027 - tipologia: riconducibile al progetto formativo - modalità di erogazione: Ex-cathedra - numero ore: 8
docente del corso: Emily Schifano qualifica: Ricercatore affiliazione: Italiana
programma delle attività: Il corso, organizzato dalla Scuola BeMM, illustra alcuni importanti sistemi modello eucariotici e ne presenta caratteristiche, aspetti metodologici ed applicazioni nel campo della biologia. Il corso è diviso in moduli monotematici; ogni modulo comprende 4 ore di teoria e 4 ore di pratica. Il secondo modulo è dedicato a Caenorhabditis elegans
modalità di accertamento finale: Test valutativo
Sistemi modello in biologia - modulo 3: Arabidopsis
data presunta: 2026.2027 - tipologia: riconducibile al progetto formativo - modalità di erogazione: Ex-cathedra - numero ore: 8
docente del corso: Simone Ferrari qualifica: Professore affiliazione: Italiana
programma delle attività: Il corso, organizzato dalla Scuola BeMM, illustra alcuni importanti sistemi modello eucariotici e ne presenta caratteristiche, aspetti metodologici ed applicazioni nel campo della biologia. Il corso è diviso in moduli monotematici; ogni modulo comprende 4 ore di teoria e 4 ore di pratica. Il terzo modulo è dedicato ad Arabidopsis thaliana.
modalità di accertamento finale: Test valutativo
Produzione e ingegneria delle proteine: dalla biologia alle nanobiotecnologie
data presunta: 2026-2027 - tipologia: riconducibile al progetto formativo - modalità di erogazione: Ex-cathedra - numero ore: 12
docente del corso: Paola Baiocco, Maria Carmela Bonaccorsi, Martino Luigi Di Salvo (membri del Collegio docenti), Alessandra Bonamore qualifica: Professore affiliazione: Italiana
programma delle attività: Il corso, organizzato dalla Scuola BeMM, E' un corso TEORICO-PRATICO in lingua inglese, organizzato insieme al dottorato in Scienze della Vita, ed è aperto alle attività formative della scuola BeMM. Il corso ha l’obiettivo di formare i dottorandi del primo anno nelle principali tecniche di biologia molecolare e biochimica applicate all’espressione e alla purificazione di proteine ricombinanti. Verranno affrontati sia gli aspetti teorici sia quelli tecnico-pratici, con particolare attenzione alle applicazioni nei diversi ambiti delle biotecnologie. Nel corso delle lezioni saranno trattati temi quali la ricerca di sequenze nucleotidiche e proteiche in banche dati open source, le metodologie di DNA ricombinante per il clonaggio molecolare e l’ingegneria proteica, nonché le strategie per la produzione di proteine mediante espressione in batteri, lieviti e linee cellulari di mammifero. Saranno inoltre approfondite le principali tecniche di purificazione proteica, incluse le metodologie di frazionamento, cromatografia e analisi delle proteine purificate. Una parte del corso sarà dedicata allo studio delle proteine di membrana, con particolare riferimento alle tecnologie BacMam e nanodisc, e ai criteri di controllo di qualità delle proteine ottenute. Il corso prevede infine una panoramica e una visita al laboratorio ProFacT – Protein Factory Training Lab, attivo presso il Dipartimento di Scienze Biochimiche. Un obiettivo rilevante del corso sarà anche quello di fornire una visione d’insieme delle principali applicazioni pratiche delle biotecnologie proteiche, come la progettazione di mutanti sito-specifici per lo studio dell’attività enzimatica e dei meccanismi di inibizione, la produzione di proteine chimeriche per studi strutturali e funzionali e l’ingegnerizzazione di nanoparticelle proteiche per il rilascio di farmaci.
modalità di accertamento finale: Le modalità di accertamento finale includono la rilevazione delle presenze, la somministrazione di un questionario finale di verifica delle competenze acquisite e il rilascio di un attestato di partecipazione.
Interazioni Macromolecolari
data presunta: 2026-2027 - tipologia: riconducibile al progetto formativo - modalità di erogazione: Ex-cathedra - numero ore: 10
docente del corso: Serena Rinaldo, Angelo Toto, Gianni Colotti and Dr. Angela Tramonti (membri del Collegio docenti),Francesco Fiorentino qualifica: Professore affiliazione: Italiana
programma delle attività: Il Corso, offerto dalla Scuola BeMM. E' un corso TEORICO-PRATICO in lingua inglese ed è aperto alle attività formative della scuola BeMM. L’obiettivo principale del corso è fornire ai dottorandi del primo anno gli strumenti quantitativi necessari per lo studio dell’affinità e dei meccanismi di interazione tra macromolecole. Il corso affronta sia gli aspetti teorici sia quelli pratici legati all’energetica, alla termodinamica (stabilità e affinità), alla cinetica e ai meccanismi di legame, includendo approcci sia allo stato stazionario che transitorio (pre–steady state). In particolare, verranno trattati i principi della termodinamica delle interazioni molecolari, con la misurazione del legame mediante calorimetria a titolazione isotermica (ITC), includendo la progettazione sperimentale e l’analisi dei dati per la determinazione della stechiometria (N), della costante di dissociazione (Kd) e di altri parametri termodinamici. Saranno inoltre illustrate le metodologie per la valutazione dello stato di oligomerizzazione e dell’affinità delle interazioni mediante spettrometria di massa in condizioni native, nonché l’utilizzo della fluorimetria a scansione differenziale (DSF) per lo screening degli interattori e lo studio dei meccanismi di legame. Il corso approfondirà anche gli aspetti cinetici delle interazioni biomolecolari, con particolare riferimento all’uso della Surface Plasmon Resonance (SPR) per la determinazione delle interazioni bimolecolari. Verranno descritti l’allestimento di un esperimento di SPR e l’analisi dei dati per l’ottenimento delle costanti cinetiche di associazione e dissociazione e delle costanti di legame. Saranno inoltre presentati approcci “pre–steady state” basati su tecniche di fluorescenza per lo studio dettagliato della cinetica di legame. Infine, il corso offrirà una panoramica sulle principali infrastrutture europee dedicate allo studio delle interazioni e della cinetica, con esempi quali le piattaforme MOSBRI e Biocrystal. Le attività didattiche integrano lezioni tenute da esperti del settore con visite alle diverse infrastrutture per lo studio delle interazioni macromolecolari disponibili presso il Dipartimento di Scienze Biochimiche.
modalità di accertamento finale: Le modalità di accertamento finale includono la rilevazione delle presenze, la somministrazione di un questionario finale di verifica delle competenze acquisite e il rilascio di un attestato di partecipazione
Introduzione al Single Cell e al Spatial Transcriptomics
data presunta: 2026-2027 - tipologia: riconducibile al progetto formativo - modalità di erogazione: Ex-cathedra - numero ore: 4
docente del corso: Valerio Fulci qualifica: Professore affiliazione: Italiana
programma delle attività: Saranno illustrati i principi generali della cattura dei trascritti di singole cellule e le principali piattaforme tecnologiche disponibili. Verrà fornita una panoramica dell’analisi dei dati, con particolare attenzione alle fasi critiche di preprocessing e analisi biostatistica. Saranno inoltre presentate le tecnologie di Spatial Transcriptomics, evidenziando analogie e differenze rispetto alla single cell transcriptomics.
modalità di accertamento finale: Test valutativo
I meccanismi di difesa della replicazione: nuovi approcci metodologici e rilevanza per l’identificazione di nuovi target terapeutici
data presunta: 2026-2027 - tipologia: riconducibile al progetto formativo - modalità di erogazione: Ex-cathedra - numero ore: 6
docente del corso: Pietro Pichierri qualifica: Professore affiliazione: Italiana
programma delle attività: L’identificazione di nuovi approcci terapeutici richiede la comprensione dei meccanismi molecolari alla base delle vulnerabilità tumorali. Il corso affronta due hallmark tumorali - instabilità genomica e stress replicativo - illustrando approcci sperimentali avanzati per lo studio dei meccanismi coinvolti e il loro sfruttamento terapeutico. Verranno presentate tecniche di interattomica e genomica funzionale con esempi applicativi e possibili scenari di utilizzo nei progetti di dottorato.
modalità di accertamento finale: Test valutativo

Eventuali maggiori informazioni piano form. 1°a L'offerta formativa per il primo anno è articolata in:
(A) Corsi organizzati dal dottorato in Genetica e Biologia Molecolare;
(B) Seminari organizzati dal dottorato in Genetica e Biologia Molecolare;
(C) Corsi organizzati dalla Scuola di Dottorato BeMM;
(D) A valle dei Seminari organizzati dal dottorato GBM sono previste per i dottorandə delle sessioni “meet the speaker” per una discussione informale sul percorso scientifico, che permetta a studenti e studentesse di avere una visione ampia grazie anche all’esperienza degli oratori, non solo accademici e di rilievo internazionale.
(E) I dottorandə, infine, sono tenutə a partecipare, ogni due settimane, ai "Progress reports", ovvero incontri in cui gli studentə del 2° e 3° anno espongono l'avanzamento delle loro ricerche.
Modalità di scelta dell'argomento della tesi: La tesi viene scelta nell'ambito delle tematiche proprie del corso di dottorato e delle competenze scientifiche assicurate dal collegio dei docenti. Ogni anno, prima del concorso di ammissione, i docenti del corso di dottorato propongono delle linee di ricerca rese disponibili sul sito https://phd.uniroma1.it/web/pagina.aspx?i=3506&l=IT&p=116
Modalità delle verifiche per l'ammissione all'anno successivo Ciascun dottoranda/o del primo anno, presenta, in lingua inglese, l'attività svolta tramite la presentazione di un poster. Per l'ammissione all'anno successivo si tiene anche conto della partecipazione del dottoranda/o alle attività del corso di dottorato e alle attività svolte fuori dall'Ateneo
Momenti di presentazione, di scambio e di discussione dei risultati di ricerca da parte dei dottorandi Per raccogliere commenti e suggerimenti sull’impostazione del lavoro per le/gli studentesse/i del primo anno si prevede una presentazione del proprio progetto, tramite l'esposizione di un poster, durante l'Opening dell'anno di Corso o durante il Simposio della Scuola di dottorato BeMM. Momento di confronto e discussione, oltre che con il Collegio, con tutti i dottorande/i e i docenti della Scuola.
A valle dei Seminari organizzati dal dottorato GBM sono previste per le/i dottorande/i delle sessioni “meet the speaker” per una discussione informale sul percorso scientifico, che permetta a studenti e studentesse di avere una visione ampia grazie anche all’esperienza degli oratori, non solo accademici e di rilievo internazionale.
Attività formative, non incluse nella didattica programmata di cui ai punti precedenti, di docenti con affiliazione estera e/o di studiosi ed esperti sia italiani che stranieri provenienti da enti di ricerca, aziende e da istituzioni culturali e sociali Le/i dottorande/i vengono coinvolti nelle attività congressuali e seminariali intra ed extra accademiche raccolte e segnalate nella sezione “News, Eventi e Job offers” del sito https://phd.uniroma1.it/web/pagina.aspx?i=3506&l=IT&p=836

Elenco delle attività formative previste per i dottorandi del secondo anno
Corso in post-produzione di immagini 2D e 3D e animazione video
data presunta: a.a 2026-2027 - tipologia: riconducibile al progetto formativo - modalità di erogazione: laboratorio - numero ore: 4
docente del corso: Mattia La Torre qualifica: Ricercatore affiliazione: Italiana
programma delle attività: Il Corso è erogato dal Dottorato in Genetica e Biologa Molecolare e aperto alle attività formative della Scuola BeMM. L’obiettivo del corso è quello di fornire ai dottorandə le nozioni dei metodi di base della post-produzione delle immagini e delle animazioni video applicabili alla ricerca scientifica
modalità di accertamento finale: Test valutativo
Statistica per biologi - Modulo I Lezioni di teoria
data presunta: a.a. 2026-27 - tipologia: riconducibile al progetto formativo - modalità di erogazione: Ex-cathedra - numero ore: 8
docente del corso: Mario Fordellone qualifica: Ricercatore affiliazione: Italiana
programma delle attività: Il corso è organizzato dalla Scuola di Dottorato BeMM. L'obiettivo è quello di fornire ai dottorandi le nozioni dei metodi statistici di base applicabili alla ricerca scientifica. Programma: - Introduzione alla teoria della stima puntuale, intervallo di confidenza e verifica delle ipotesi, significatività statistica e p-value. - Test su popolazioni normali, caso di un campione, due campioni indipendenti, due campioni appaiati, più di due campioni, test post-hoc. - Verifica delle ipotesi di normalità, test su popolazioni non normali, caso di due campioni indipendenti, due campioni appaiati, più di due campioni, test post-hoc. - Statistica non parametrica - Correzione per test multipli - Teoria di base sull'analisi di sopravvivenza.
modalità di accertamento finale: da definire
Statistica per biologi - Modulo II: Parte Pratica
data presunta: a.a. 2026-27 - tipologia: riconducibile al progetto formativo - modalità di erogazione: Ex-cathedra - numero ore: 8
docente del corso: Valerio Licursi qualifica: Studioso o esperto di enti di ricerca affiliazione: Italiana
programma delle attività: Il corso è rivolto agli studenti del secondo anno della Scuola di Dottorato in Biologia Molecolare e Medicina. L'obiettivo è fornire ai dottorandi le basi dei metodi statistici applicabili alla ricerca scientifica, consentendo loro al contempo di familiarizzare con i principali pacchetti software disponibili online attraverso esercitazioni pratiche. Programma: - Introduzione a R e RStudio - Sintassi di base di R e struttura dei dati: accesso agli elementi (vettori, liste, dataframe) - Gestione e visualizzazione dei dati - Esplorazione e manipolazione dei dati in R con tidyverse - Utilizzo del pacchetto R ggplot2 per visualizzare i dati e creare grafici - Esercitazioni pratiche: test statistici con R su dati reali
modalità di accertamento finale: da definire
Seminari dal Ciclo Progressi nel campo della Biologia Molecolare
data presunta: a.a. 2026-27 - tipologia: riconducibile al progetto formativo - modalità di erogazione: Ex-cathedra - numero ore: 10
docente del corso: qualifica: Professore affiliazione: Italiana
programma delle attività: Seminari organizzati dal Dottorato in Genetica e Biologia Molecolare
modalità di accertamento finale:
Seminari dal Ciclo Progressi nel campo della Genetica
data presunta: a.a. 2026-27 - tipologia: riconducibile al progetto formativo - modalità di erogazione: Ex-cathedra - numero ore: 10
docente del corso: qualifica: Professore affiliazione: Italiana
programma delle attività: Seminari organizzati dal Dottorato in Genetica e Biologia Molecolare
modalità di accertamento finale:
Tecniche di microscopia per le scienze della vita
data presunta: 2026-2027 - tipologia: riconducibile al progetto formativo - modalità di erogazione: Ex-cathedra - numero ore: 19
docente del corso: Silvia Di Angelantonio, Annarita Fiorillo (membro del Collegio), Raffaele Strippoli, Sapienza; De Stenafo; docenti esterni qualifica: Professore affiliazione: Italiana
programma delle attività: E' un corso TEORICO-PRATICO. E' in inglese ed è aperto alle attività formative della scuola BeMM. Programma: Benvenuto e introduzione Microscopia ottica convenzionale e confocale Microscopia multifotonica per applicazioni in vitro e in vivo – painting DEEP SIM STED Microscopia elettronica a trasmissione (E. De Stefano – Sapienza – BBCD – CRiN) Cryo-EM (G. Giardina – Sapienza – DSB) Tecniche di clearing (Nicolas Bayens – ULB) Applicazioni – imaging ionico Applicazioni della microscopia a fluorescenza e confocale in fisiopatologia: dimostrazione della plasticità cellulare (EMT/MET), saggi di adesione, migrazione/invasione e sviluppo di organoidi tumorali (R. Strippoli – Sapienza – DMM) Analisi e quantificazione delle immagini – ImageJ
modalità di accertamento finale: Valutazione personale del corso tramite la compilazione di un questionario online.
Biologia strutturale: nozioni di base, infrastruttura e applicazione
data presunta: 2026-2027 - tipologia: riconducibile al progetto formativo - modalità di erogazione: Ex-cathedra - numero ore: 14
docente del corso: Adele Di Matteo, Andrea Ilari, Annarita Fiorillo (membri del Collegio), Carlo Travaglini-Allocatelli, Carmelinda Savino; Sonia Longhi (membro del Collegio con affiliazione estera, Laboratory AFMB – Architecture and Function of biological macromolecules, CNRS – Aix-Marseille Univ.) e Michele Vendruscolo (membro del Collegio Docenti con affiliazione straniera: Yusuf Hamied Department of Chemistry, University of Cambridge) qualifica: Professore affiliazione: Italiana
programma delle attività: E' un corso teorico-pratico in lingua INGLESE e aperto alle attività formative della scuola BeMM. Il corso fornisce una panoramica completa della biologia strutturale, coprendone i principi fondamentali, le infrastrutture, le diverse applicazioni e le prospettive future. Gli studenti acquisiranno una comprensione approfondita del carattere interdisciplinare della biologia strutturale e del suo ruolo centrale nel progresso della ricerca scientifica e delle innovazioni tecnologiche in diversi ambiti. Modulo 1: Cristallografia a raggi X: dal cristallo alla struttura 3D (A. Di Matteo, C. Savino) (4 ore) Il primo modulo è dedicato ai metodi della biologia strutturale e presenta tecniche quali la cristallografia a raggi X, la spettroscopia NMR e la microscopia crio-elettronica (cryo-EM). L’attenzione sarà rivolta in particolare alla cristallografia a raggi X, approfondendo i principi e le metodologie della cristallizzazione delle proteine, la determinazione e il raffinamento delle strutture tridimensionali, la validazione strutturale e le infrastrutture disponibili. Modulo 2: Cryo-EM a particella singola (A. Fiorillo) (2 ore) Il secondo modulo si concentra sui principi e sulle metodologie della cryo-EM a singola particella Modulo 3: Applicazioni della biologia strutturale (A. Ilari) (2 ore) Il terzo modulo esplora le applicazioni della biologia strutturale, con particolare enfasi sul suo ruolo nel drug design razionale e nello sviluppo di strategie di targeting basate sulla struttura. Modulo 4: Applicazioni dell’intelligenza artificiale nella biologia strutturale (M. Vendruscolo) (2 ore) Il quarto modulo è dedicato alle applicazioni dell’intelligenza artificiale nella biologia strutturale e analizza come strumenti e algoritmi basati sull’IA stiano rivoluzionando la predizione strutturale, l’analisi dei dati e la scoperta di nuovi farmaci. Il modulo include inoltre casi di studio che illustrano l’integrazione dell’IA nella risoluzione di complesse problematiche biologiche. Modulo 5: Folding e aggregazione proteica (C. Travaglini-Allocatelli e S. Longhi) (4 ore) Il quinto modulo introduce i fondamenti della struttura macromolecolare, a partire dagli amminoacidi, ed esplora la stabilità delle proteine, i meccanismi di folding, gli esperimenti di folding e i processi di aggregazione. Il modulo affronta inoltre il tema delle proteine disordinate, trattandone le caratteristiche generali, le definizioni, le proprietà, le funzioni, i metodi di predizione e la caratterizzazione sperimentale. Il corso si conclude con un approfondimento sulla separazione di fase liquido-liquido (LLPS) e sulle sue implicazioni nei processi biologici, inclusa la replicazione virale.Il corso beneficia delle risorse della Biocrystal Facility, offerta in collaborazione con il Dipartimento di Scienze Biochimiche e l’Istituto IBPM – CNR (https://biocrystalfacility.it/en/biocrystal-facility/). Ulteriori collaborazioni includono il CNRS di Marsiglia e l’Università di Cambridge, che contribuiscono ad arricchire le opportunità formative e di ricerca offerte dal corso.
modalità di accertamento finale: The final assessment methods include attendance tracking, a final questionnaire to assess the acquired competencies, and the issuance of a certificate of participation
Metabolismo e metaboliti
data presunta: 2026-2027 - tipologia: riconducibile al progetto formativo - modalità di erogazione: Ex-cathedra - numero ore: 14
docente del corso: Mario Fontana, Alberto Macone, Elena Forte (membri del Collegio); Alessio Paone, Daniela De Biase qualifica: Professore affiliazione: Italiana
programma delle attività: ,E' un corso teorico-pratico tenuto in lingua inglese organizzato insieme al dottorato in Scienze della Vita ed è aperto alle attività formative della Scuola BeMM. Obiettivi del corso Il corso ha l’obiettivo di fornire una panoramica delle diverse metodologie finalizzate allo studio del metabolismo cellulare e della metabolomica. Gli studenti acquisiranno una conoscenza approfondita delle tecniche cromatografiche (LC e GC) accoppiate alla rivelazione mediante spettrometria di massa, della gestione dei dati omics e delle analisi respirometriche ad alta risoluzione. Modulo 1Introduzione alla cromatografia liquida nell’analisi metabolomica. Cromatografia liquida/spettrometria di massa: principi e applicazioni. Oncometaboliti. Analisi dei dati omics.Modulo 2 Analisi in tempo reale del metabolismo cellulare mediante tecnologia Seahorse. Introduzione al metabolismo cellulare e alla tecnologia Seahorse. Funzioni principali della piattaforma Seahorse: misurazione della respirazione mitocondriale e della glicolisi in cellule vive. Applicazioni nella ricerca biomedica, oncologica e farmacologica. Dimostrazione interattiva: utilizzo del software Seahorse e interpretazione dei dati. Presentazione dello strumento Oroboros. Approccio multi-omico integrato per lo studio degli effetti degli antibiotici sul metabolismo microbico. Modulo 3 Cromatografia gassosa. Introduzione alla cromatografia gassosa. Principi e applicazioni della GC/MS. Preparazione dei campioni per analisi GC/MS.Metodologia didattica Il corso prevede lezioni frontali, discussioni guidate e presentazioni di progetti. Gli studenti saranno incoraggiati a partecipare attivamente, porre domande e applicare le conoscenze acquisite in attività pratiche. Considerazioni finali. Il corso mira a fornire agli studenti una comprensione completa delle metodologie e delle pratiche per l’utilizzo di modelli cellulari e animali, preparandoli a condurre attività di ricerca avanzata e a contribuire al progresso scientifico in ambito biomedico.
modalità di accertamento finale: Le modalità di accertamento finale includono la rilevazione delle presenze, la somministrazione di un questionario finale di verifica delle competenze acquisite e il rilascio di un attestato di partecipazione
Mutational Signatures in Cancer Genomics
data presunta: 2026-2027 - tipologia: riconducibile al progetto formativo - modalità di erogazione: Ex-cathedra - numero ore: 3
docente del corso: Tommaso Mazza, Andrea Gazzo qualifica: Studioso o esperto di enti di ricerca affiliazione: Italiana
programma delle attività: Il corso introduce il concetto di mutational signatures come pattern derivati da dati di sequenziamento, evidenziando come le mutazioni somatiche riflettano i processi di danno e riparazione del DNA. Verranno presentate le principali tipologie di firme mutazionali e il loro collegamento con meccanismi biologici rilevanti. Il corso fornirà inoltre una panoramica degli approcci computazionali per la loro analisi e ne discuterà le potenziali applicazioni come biomarcatori in ambito oncologico, in particolare per la classificazione dei tumori e il supporto alle strategie terapeutiche.
modalità di accertamento finale: Test valutativo
Dalle cellule ai modelli animali: linee guida e migliori pratiche
data presunta: 2026-2027 - tipologia: riconducibile al progetto formativo - modalità di erogazione: Ex-cathedra - numero ore: 16
docente del corso: Prof.ssa Tramutola, Prof. Di Domenico, Prof. Barone, Prof. Mangoni, Prof. Di Angelantonio, Prof. Sanchini, Prof. Basilico (Sapienza), Prof Cenci (Sapienza), Prof. Martinelli qualifica: Professore affiliazione: Italiana
programma delle attività: Il corso è aperto alle attività formative della scuola BeMM. Il corso ha l’obiettivo di fornire una panoramica completa delle linee guida e delle migliori pratiche per l’utilizzo di modelli cellulari e animali in ambito scientifico e di ricerca. Gli studenti acquisiranno una conoscenza approfondita delle tecniche di coltura cellulare, della manipolazione genetica e dell’applicazione dei modelli animali negli studi biomedici. Modulo 1: Introduzione ai modelli cellulari e animali Basi della coltura cellulare: tecniche per il mantenimento e la proliferazione delle cellule. Principi fondamentali dell’etica nella ricerca che utilizza modelli animali. Vantaggi e limiti dei modelli cellulari e animali. Modulo 2: Coltura cellulare e manipolazione genetica Tecniche avanzate di coltura cellulare: linee cellulari stabili e cellule primarie. Principi di manipolazione genetica in vitro: trasfezione, trasduzione e CRISPR-Cas9. Discussione sull’impatto della manipolazione genetica in vitro sulla validità dei risultati. Modulo 3: Metodi in vitro e alternative avanzate alla sperimentazione animale Modelli di malattia umani derivati da iPSC biostampati in 3D o auto-assemblati. Analisi funzionale di organoidi 3D e costrutti biostampati (MEA, imaging del calcio, patch clamp). Modulo 4: Modelli animali nella ricerca biomedica Scelta del modello animale più appropriato in base alle domande di ricerca. Aspetti etici dell’utilizzo dei modelli animali e conformità alle normative vigenti. Valutazione dei parametri fisiologici nei modelli animali. Modulo 5: Progettazione di studi con modelli animali Protocolli sperimentali e pianificazione degli studi con modelli animali. Monitoraggio e raccolta dei dati nei modelli animali. Analisi statistica e interpretazione dei risultati. Modulo 6: Buone pratiche e prospettive future Linee guida internazionali per l’utilizzo dei modelli cellulari e animali. Casi di successo ed esempi applicativi nell’impiego dei modelli per la ricerca biomedica. Prospettive future: avanzamenti tecnologici e approcci innovativi.
modalità di accertamento finale: Le modalità di accertamento finale includono la rilevazione delle presenze, la somministrazione di un questionario finale di verifica delle competenze acquisite e il rilascio di un attestato di partecipazione.

Eventuali maggiori informazioni piano form. 2° L'offerta formativa per il secondo anno è articolata in:
(A) Corsi organizzati dal dottorato in Genetica e Biologia Molecolare;
(B) Seminari organizzati dal dottorato in Genetica e Biologia Molecolare;
(C) Corsi organizzati dalla Scuola di Dottorato BeMM;
(D) A valle dei Seminari organizzati dal dottorato GBM sono previste per i dottorandə delle sessioni “meet the speaker” per una discussione informale sul percorso scientifico, che permetta a studenti e studentesse di avere una visione ampia grazie anche all’esperienza degli oratori, non solo accademici e di rilievo internazionale;
(E) I dottorandə, infine, sono tenuti a partecipare, ogni due settimane ai “Progress reports”, ovvero ad incontri in cui espongono l'avanzamento delle loro ricerche.
Modalità delle verifiche per l'ammissione all'anno successivo Oltre alla frequenza delle attività didattiche il dottorandə svolge il lavoro sperimentale in laboratorio, supervisionato sia dal Docente Guida che dal Tutor esterno. Durante i Progress report (in inglese) il Collegio dei Docenti ha modo di intervenire nell'avanzamento del lavoro e di poter suggerire, se necessario, delle modifiche.
Per l'ammissione all'anno successivo, il Collegio dei Docenti giudica l’esposizione del lavoro svolto dal dottorandə e tiene anche conto della partecipazione del dottorandə alle attività didattiche. A questo fine, ogni dottorandə invia una relazione in cui oltre agli aspetti sperimentali riporta l'elenco della attività seguite sia interne che esterne all'Ateneo.
Momenti di presentazione, di scambio e di discussione dei risultati di ricerca da parte dei dottorandi A valle dei Seminari organizzati dal dottorato GBM sono previste per i dottorandə delle sessioni “meet the speaker” per una discussione informale sul percorso scientifico, che permetta a studenti e studentesse di avere una visione ampia grazie anche all’esperienza degli oratori, non solo accademici e di rilievo internazionale.
I dottorandə, infine, sono tenuti a partecipare, ogni due settimane ai “Progress reports”, ovvero ad incontri in cui espongono l'avanzamento delle loro ricerche.
Attività formative, non incluse nella didattica programmata di cui ai punti precedenti, di docenti con affiliazione estera e/o di studiosi ed esperti sia italiani che stranieri provenienti da enti di ricerca, aziende e da istituzioni culturali e sociali I dottorande/i vengono coinvolti nelle attività congressuali e seminariali intra ed extra accademiche raccolte e segnalate nella sezione “News, Eventi e Job offers” del sito https://phd.uniroma1.it/web/pagina.aspx?i=3506&l=IT&p=836

Elenco delle attività formative previste per i dottorandi del terzo anno
Alternative di carriera nella scienza
data presunta: 2026-2027 - tipologia: riconducibile al progetto formativo - modalità di erogazione: Ex-cathedra - numero ore: 2
docente del corso: Associazione Giovanile Laboratorio 11 qualifica: Altro affiliazione: Italiana
programma delle attività: Il corso è organizzato dal Dottorato in Genetica e Biologia Molecolare ed è aperto alle attività formative della Scuola BeMM, ha la funzione di ampliare il panorama degli sbocchi professionali per i dottorandə, mettendoli in comunicazione con diverse realtà lavorative. Il corso verrà svolto con la partecipazione dell'associazione "Inside-out” di giovani post-doc in Sapienza.
modalità di accertamento finale: Da definire
Parlare in pubblico
data presunta: 2026-2027 - tipologia: riconducibile al progetto formativo - modalità di erogazione: Ex-cathedra - numero ore: 8
docente del corso: Giornalista scientifico qualifica: Altro affiliazione: Italiana
programma delle attività: Il corso è organizzato dal Dottorato in Genetica e Biologia Molecolare ed è aperto alle attività formative della Scuola BeMM. In questo corso si vogliono fornire ai dottorandə le basi di come ci si confronta coi giornalistə e coi mezzi di comunicazione di massa: che cosa cercano, chi sono i pubblici, come si possono raggiungere nel modo migliore, senza equivoci, senza conflitti, e magari con reciproca soddisfazione. Teoria e pratica dell’intervista: dalla carta stampata, alla radio, alla tv. Ma anche alcuni suggerimenti di scrittura e di comunicazione dal vivo per chi vuole fare da sé, senza troppi mediatori.
modalità di accertamento finale: Test valutativo
Preparazione di immagini grafiche per articoli scientifici
data presunta: 2026-2027 - tipologia: riconducibile al progetto formativo - modalità di erogazione: Ex-cathedra - numero ore: 8
docente del corso: Prof. Giorgio Giardina, Prof. Gianni Stefano qualifica: Professore affiliazione: Italiana
programma delle attività: Il corso, organizzato dalla Scuola di Dottorato BeMM, mira a fornire agli studentə una conoscenza di base del software e degli strumenti utilizzati per produrre immagini di qualità editoriale per articoli scientifici, poster o presentazioni. : Il corso coprirà le conoscenze di base della progettazione grafica quali: risoluzione delle immagini; immagini vettoriali e immagini raster; teoria del colore e spazi colore (RGB, CMYK); regole di base per un buon disegno della figura. Agli studentə verrà poi presentato il software grafico professionale open source per il fotoritocco (GIMP) e la grafica vettoriale (Inkscape). Infine, verrà trattato l'intero flusso di lavoro su come scrivere e pianificare le cifre di un articolo scientifico.
modalità di accertamento finale: Da definire
Seminari dal ciclo Progressi nel campo della Biologia Molecolare
data presunta: a.a. 2026-2027 - tipologia: riconducibile al progetto formativo - modalità di erogazione: Ex-cathedra - numero ore: 10
docente del corso: qualifica: Professore affiliazione: Italiana
programma delle attività: Seminari organizzati dal Dottorato in Genetica e Biologia Molecolare
modalità di accertamento finale:
Seminari dal ciclo Progressi nel campo della Genetica
data presunta: 2026-2027 - tipologia: riconducibile al progetto formativo - modalità di erogazione: Ex-cathedra - numero ore: 10
docente del corso: qualifica: Professore affiliazione: Italiana
programma delle attività: Seminari organizzati dal Dottorato in Genetica e Biologia Molecolare
modalità di accertamento finale:
Parità di genere nelle carriere STEM
data presunta: 2026-2027 - tipologia: riconducibile al progetto formativo - modalità di erogazione: Ex-cathedra - numero ore: 4
docente del corso: Barbara Perrini qualifica: Studioso o esperto di aziende o istituzioni culturali o sociali affiliazione: Italiana
programma delle attività: Il workshop, tenito dalla Scuola BeMM, mira a fornire strumenti per riconoscere e mettere in discussione gli stereotipi di genere; analizzare l’iceberg della violenza di genere; correlare le riflessioni sugli stereotipi e sulle diverse forme di violenza di genere con l’autodeterminazione personale, rispetto all’analisi statistica della forbice delle carriere in ambito STEM.
modalità di accertamento finale: non prevista
Ricerca dual-use, biotecnologie emergenti e bioterrorismo
data presunta: 2026-2027 - tipologia: riconducibile al progetto formativo - modalità di erogazione: Ex-cathedra - numero ore: 1
docente del corso: Teresa Rinaldi qualifica: Professore affiliazione: Italiana
programma delle attività: Lo scopo del seminario, tenuto dalla Scuola BeMM, è quello di discutere, anche attraverso casi realmente accaduti, i possibili rischi dell'utilizzo delle tecnologie emergenti per scopi malevoli. Verranno presentate anche le azioni che vengono attuate in Sapienza (ed a livello mondiale) per la prevenzione al bioterrorismo. Cenni sulle armi chimiche di quarta generazione.
modalità di accertamento finale: Non prevista
Piano di sviluppo della carriera per i ricercatori nella fase iniziale
data presunta: 2026.2027 - tipologia: riconducibile al progetto formativo - modalità di erogazione: Ex-cathedra - numero ore: 6
docente del corso: Prof. Alberto Boffi qualifica: Professore affiliazione: Italiana
programma delle attività: Il corso è in lingua inglese ed e aperto alle attività formative della scuola BeMM. Il piano di sviluppo della carriera è una strategia strutturata e completa che gli individui elaborano per guidare la propria crescita e progressione professionale. Esso prevede la definizione di obiettivi di carriera sia a breve sia a lungo termine, l’individuazione delle competenze e delle conoscenze necessarie per raggiungerli e la pianificazione di azioni specifiche e tappe intermedie per conseguirli. Un piano di sviluppo della carriera ben strutturato non solo aiuta a orientarsi nel proprio percorso professionale, ma consente anche di assumere un ruolo attivo e consapevole nel proprio sviluppo. Questo approccio proattivo include attività di autovalutazione, formazione continua, networking e la ricerca di opportunità per il potenziamento delle competenze. Attraverso una revisione e un aggiornamento periodici del piano, è possibile adattarsi a contesti in evoluzione, cogliere nuove opportunità e mantenere l’allineamento con aspirazioni professionali in continuo cambiamento. In definitiva, un piano di sviluppo della carriera attentamente progettato rappresenta una vera e propria roadmap per realizzare il proprio potenziale e raggiungere un percorso professionale soddisfacente e di successo. Il corso è dedicato agli Early Stage Researchers, comprendendo dottorandi e post-doc. È articolato in tre aree tematiche principali: 1.piano di sviluppo della carriera per il percorso accademico (Università italiane); 2.piano di sviluppo della carriera nelle istituzioni di ricerca (nazionali e internazionali); 3. piano di sviluppo della carriera nel settore privato.
modalità di accertamento finale: Scrivi il tuo primo CDP (il modulo verrà fornito)
Preparazione di illustrazioni per articoli scientifici
data presunta: 2026-2027 - tipologia: riconducibile al progetto formativo - modalità di erogazione: Ex-cathedra - numero ore: 8
docente del corso: Giorgio Giardina, Prof. Gianni Stefano qualifica: Professore affiliazione: Italiana
programma delle attività: Corso organizzato dal dottorato in BIOCHIMICA in lingua inglese ed è aperto alle attività formative della scuola BeMM. Il corso ha l’obiettivo di fornire agli studenti una conoscenza di base dei software e degli strumenti utilizzati per realizzare materiale grafico di qualità editoriale destinato ad articoli scientifici, poster e presentazioni. Il corso include inoltre una sezione dedicata alla scrittura scientifica. Programma Il corso tratterà le basi del graphic design, quali la risoluzione delle immagini, le differenze tra immagini vettoriali e raster, la teoria del colore e gli spazi colore (RGB, CMYK), nonché le regole fondamentali per una corretta progettazione delle figure. Gli studenti verranno quindi introdotti all’utilizzo di software grafici professionali open source per il fotoritocco (GIMP) e per la grafica vettoriale (Inkscape). Infine, verrà illustrato l’intero flusso di lavoro relativo alla pianificazione e alla realizzazione delle figure di un articolo scientifico. Risultati attesi Al termine del corso, gli studenti saranno in grado di: 1. progettare e realizzare da zero un’immagine multi-pannello, includendo la modifica delle immagini di partenza, delle legende e dei diagrammi, l’esportazione di dati e grafici come file immagine, l’organizzazione del layout e l’assemblaggio finale della figura; 2. preparare figure e illustrazioni scientifiche in conformità alle linee guida editoriali, utilizzando i principali strumenti dei software open source GIMP e Inkscape per la modifica di immagini raster e vettoriali; 3. progettare ed esportare immagini nel formato corretto, con proprietà ottimizzate in funzione dello specifico mezzo di comunicazione (ad esempio articoli scientifici, progetti di ricerca, presentazioni orali, poster); 4. organizzare il testo di un manoscritto scientifico secondo principi efficaci di storytelling.
modalità di accertamento finale:

Eventuali maggiori informazioni piano form. 3° L'offerta formativa per il terzo anno è articolata in:
(A) Corsi organizzati dal dottorato in Genetica e Biologia Molecolare;
(B) Seminari organizzati dal dottorato in Genetica e Biologia Molecolare;
(C) Corsi organizzati dalla Scuola di Dottorato BeMM;
(D) A valle dei Seminari organizzati dal dottorato GBM sono previste per i dottorandə delle sessioni “meet the speaker” per una discussione informale sul percorso scientifico, che permetta a studenti e studentesse di avere una visione ampia grazie anche all’esperienza degli oratori, non solo accademici e di rilievo internazionale.
(E) I dottorandə, infine, sono tenuti a partecipare, ogni due settimane ai “Progress reports”, ovvero ad incontri in cui espongono l'avanzamento delle loro ricerche
Modalità di ammissione all'esame finale Gli studentə del terzo anno presentano, in lingua inglese, il loro percorso di ricerca durante i "Progress reports". Il Collegio dei Docenti, presa visione delle attività complessiva del dottorandə, del numero e del posizionamento delle sue pubblicazioni, esprime un giudizio collegiale e ne valuta l'ammissibilità all'esame finale. I dottorandə ammessi dovranno quindi presentare il loro elaborato finale a due revisori esterni al Collegio, scelti seguendo le direttive ministeriali ed il regolamento d'Ateneo. I revisori esprimeranno un loro giudizio e l'ammissibilità all'esame finale.
Modalità di svolgimento dell'esame finale L'elaborato per l’esame finale è scritto in lingua inglese ed è firmato per accettazione sia dal Docente Guida che dal Tutor. L'esame finale consiste in una presentazione sul lavoro svolto. La Commissione esprime un giudizio che tiene conto sia della presentazione del lavoro svolto che percorso complessivo del candidatə.
L'esame finale si tiene in una delle tre sessioni disponibili successive alla fine del corso di dottorato ovvero entro il 30 gennaio, il 30 maggio, il 30 settembre ed un mese prima andrà nominata la commissione giudicatrice. Entro sei mesi dalla discussione finale i docenti guida identificheranno i revisori esterni a cui verranno inviate le tesi 3 mesi prima della discussione e il cui giudizio verrà inviato successivamente alla commissione
Momenti di presentazione, di scambio e di discussione dei risultati di ricerca da parte dei dottorandi Ai Seminari organizzati dal dottorato GBM seguono delle sessioni “meet the speaker” per una discussione informale sul percorso scientifico, che permetta ai dottorandə di avere una visione ampia grazie anche all’esperienza degli oratori, non solo accademici e di rilievo internazionale. I dottorandə del terzo anno vengono particolarmente incoraggiati a partecipare a questa attività cruciale anche per il disegno delle prospettive post-dottorali.
I dottorandə, infine, sono tenuti a partecipare, ogni due settimane ai “Progress reports”, ovvero ad incontri in cui espongono l'avanzamento delle loro ricerche.

I dottorandə, infine, sono tenuti a partecipare, ogni due settimane ai “Progress reports”, ovvero ad incontri in cui espongono l'avanzamento delle loro ricerche.
Attività formative, non incluse nella didattica programmata di cui ai punti precedenti, di docenti con affiliazione estera e/o di studiosi ed esperti sia italiani che stranieri provenienti da enti di ricerca, aziende e da istituzioni culturali e sociali I dottorandə vengono coinvolti nelle attività congressuali e seminariali intra ed extra accademiche raccolte e segnalate nella sezione “News, Eventi e Corsi” del sito https://phd.uniroma1.it/web/pagina.aspx?i=3506&l=IT&p=836

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