PROGETTI EUROPEI: 1 progetto.
SPAZI E POSTAZIONI DI LAVORO
Ai dottorandi viene sempre assegnato uno spazio di lavoro dedicato nei singoli laboratori dei supervisori e tutor.
Nei Dipartimenti di afferenza dei singoli supervisori sono inoltre presenti sale comuni dedicate ai dottorandi (alcuni esempi riportati di seguito).
Dipartimento di Scienze Biochimiche (Edificio CU027) è a disposizione una stanza con postazioni di lavoro per dottorandi e post-doc che operano nel Dipartimento, come anche una sala lettura nell'edificio CU010.
Dip. di Scienze e Biotecnologie Medico Chirurgiche è presente una sala studio studenti comune aperta dalle 8 alle 18,30.
Edificio RM026 Viale di Porta Tiburtina 28, ai dottorandi viene assegnato uno spazio di lavoro dedicato nei laboratori al Piano terra.
Dipartimento di Sanità Pubblica e Malattie Infettive (edificio CU015) Sezione di Microbiologia, è a disposizione una stanza con postazioni di lavoro per dottorandi che operano nella Sezione. Dipartimento Biologia e Biotecnologie, Istituto di Genetica (CU022) tutti i Dottorandi hanno una scrivania all'interno di una sala studio condivisa (terzo piano).
Laboratori ed attrezzature specializzate disponibili nei singoli Dipartimenti vengono descritti in dettaglio nella voce ATTREZZATURE SCIENTIFICHE
ATTREZZATURE SCIENTIFICHE
Attrezzature Hardware e Software specializzate. E' disponibile un'aula informatizzata presso il Dipartimento di Scienze Biochimiche dotata di 15 postazioni di calcolo, dedicata al calcolo avanzato e disponibile anche per l'attività didattica frontale e tutoriale del dottorato.
Sono inoltre disponibili computer per il calcolo avanzato in ambito bioinformatico e di biologia strutturale con alcuni programmi dedicati quali ad esempio:
Pymol 2.5, Pymod 3, DockingPie 1.2 Python 3, MVD 7.0, Vina, Autodock Gromacs, Amber,CCP4 suite (Coot) Phenix, Chimera Relion Cryospark
Si segnala inoltre:
- Accesso a High Performance computing attraverso il CINECA. Questa modalità è particolarmente importante per l'analisi dei dati complessi (Big Data), linea di ricerca attiva nell'ambito del nostro Dottorato.
- Accesso alle maggiori banche dati biologiche (disponibili pubblicamente): gli studenti vengono istruiti sul loro uso e modalità' di accesso.
Attrezzature scientifiche caratterizzanti: Nei laboratori di ricerca a cui afferiscono i dottorandi sono disponibili le attrezzature di base per lo svolgimento delle. attività sperimentali. Si segnalano qui alcune attrezzature di particolare rilievo presenti nei dipartimenti di afferenza dei supervisori, di cui essi sono responsabili o a cui i dottorandi possano accedere. Qunado possibile, sono stati indicati gli indirizzi web delle singole piattaforme/o dei laboratori in cui esse sono presenti.
2 Sequenziatori genomici della Oxford Nanopore Technologies tipo MK1C
Lifereal Nanoready (Nanodrop)
FastGene B/G FASBOX Nippon Genetics
QIAcuity One 5-PLEX Device (Digital PCR) QIAGEN,
Facility di Microscopia (Confocale, Microscopia Time Lapse ecc...in Via dei Sardi). https://research.uniroma1.it/laboratorio/193436
Facility Rarity (Raggi x e simulatore di Gravità) https://research.uniroma1.it/laboratorio/192411
https://research.uniroma1.it/laboratorio/192452
Ecografo VEVO 3100 VISUALSONIC. https://research.uniroma1.it/laboratorio/145227.
HYP-ACB https://research.uniroma1.it/laboratorio/144671#/0
PROFACT https://research.uniroma1.it/laboratorio/145145#/0
ARP https://research.uniroma1.it/laboratorio/144295
https://research.uniroma1.it/laboratorio/145238
Microscopio confocale Spinning disk; Microscopio multifotone Utlima 2P Plus; 2 setup da patch clamp; 2 setup da calcium imaging; 1 multielectrode array
https://research.uniroma1.it/laboratorio/16382
BD FACSAria III per cell sorting, BD FACSCanto II per analisi citofluorimetrica e BD FACSymphony per analisi multiparametriche (fino a 30 colori),
BD Rhapsody System per l’analisi del trascrittoma a livello di singola cellula,
piattaforma di sequenziamento Illumina HiSeq1500 con tecniche di nuova generazione (NGS), spettrometro di massa Orbitrap Fusion Tribid della Thermo Scientific per l’analisi di proteomica e metabolomica, lettore multiplex Bio-Plex MAGIX, modulo di inclusione a paraffina riscaldata Leica EG1150 H e microtomo semiautomatico Leica RM2245, un microscopio a fluorescenza Zeiss Axio Scope A.1 supportato dalla telecamera AxioCam 208, un microscopio confocale spettrale ZEISS su stativo rovesciato Modello LSM 980 implementato con un sistema in super risoluzione Airyscan2 per live-imaging veloce e time lapse e con il software AxioObserver 7.
MicroscopiO confocale Celldiscoverer 7, Carl Zeiss AG; Spettrometro di massa Q Exactive plusTM Hybrid Quadrupole-OrbitrapTM Mass Spectrometer (Thermo Fisher Scientific);
Attrezzature presso Spallanzani INMI: microscopio confocale Celldiscoverer 7, Carl Zeiss AG; analizzatore di microvescicole EXOID IZON; Spettrometro di Massa Q Exactive plusTM Hybrid Quadrupole-OrbitrapTM Mass Spectrometer (Thermo Fisher Scientific)
https://research.uniroma1.it/laboratorio/145303#/0
CITOFLUORIMETRO: CytoFLEX V5/B5/R3 (13 Detector, 3 Laser) - Beckman Coulter
DIGITAL PCR: Digital Qiacuity One, 5-Plex Device - QIAGEN
CHEMILUMINESCENZA: Chemidoc Image System - BioRad
Stanza cellule P2 al CU026. Le facilities di ricerca all'interno del CLN2S (https://n4n.iit.it/facilities) possono essere utilizzate da dottorandi con borsa IIT.
CItofluorimetri convenzionali: BD LSR Fortessa (13 colori) e FACSCAnto (6 colori). Accesso a sorter spettrale Cytek Aurora CS acquisito con Bando Grandi Attrezzature di Ateneo.
UV Perkin-Elmer 552 Spectrophotometer, NMR Bruker AC400 Spectrometer,Thermo Scientific UltiMate 3000 UHPLC System,Thermo Scientific MSQ Plus Mass Spectrometer, CoronaVeo Charged Aerosol Detector,Buchi RII Rotavapors,Heidolph Rotavapors,PARR Hydrogenator,Stuart melting point apparatus, Biotage Initiator Microwave Reactor, Biotage Isolera One Flash Chromatography System,Perkin Elmer EnSight Multimode Plate Reader, ThalesNano H-Cube Pro Hydrogenation Flow Reactor, Thermo Scientific Q Exactive UHMR Hybrid Quadrupole-Orbitrap Mass Spectrometer
BIBIOTECHE: sono accessibili agli studenti le biblioteche reali e virtuali di Sapienza e di tutte le altre
sedi consorziate
STRUTTURE ASSISTENZIALI: L'attività di ricerca di alcuni dottorandi si svolge all'interno di strutture con aspetti assistenziali, quali: Policlinico Umberto I
INMI Lazzaro Spallanzani,
IRCCS Neuromed
ICOT Latina
Ospedale S.Maria Goretti Latina Ospedale Pediatrico Bambino Gesù
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