| Elenco delle attività formative previste per i dottorandi del terzo anno |
Corso di grafica per la preparazione di articoli scientifici
data presunta: 2028/2029 - tipologia: riconducibile al progetto formativo - modalità di erogazione: Ex-cathedra - numero ore: 8
docente del corso: Giorgio Giardina, Gianni Stefano, Dept. Biochemical Sciences, sapienza University of Rome qualifica: Professore affiliazione: Italiana
programma delle attività: Il corso è rivolto agli studenti della Scuola di Dottorato in Biologia e Medicina Molecolare (BeMM) a cui questo Dottorato afferisce ed è organizzato dal corso di dottorato in Biochimica. Il corso si prefigge di fornire agli studenti una buona conoscenza dei programmi utilizzati per generare grafici e modellini adatti a pubblicazioni scientifiche, progetti di ricerca, poster o presentazioni. Progettazione grafica: risoluzione delle immagini; teoria del colore e spazi colore (RGB, CMYK); regole di base per un buon disegno della figura. Agli studenti verrà poi presentato il software grafico professionale open source per il fotoritocco (GIMP) e la grafica vettoriale (Inkscape). Una parte del corso sarà dedicata alle modalità di scrittura di un articolo scientifico. Course program (English): The course aims at giving the students a basic knowledge of the software and tools used to produce publication quality artwork for scientific papers, posters or presentations. A section on scientific writing is also part of the course. Programme: The course will cover the basic knowledge of graphic design such as: image resolution; vector vs raster images; colour theory and colour spaces (RGB, CMYK); basic rules for a good figure design. The students will then be introduced to the professional open-source graphic software for photo editing (GIMP) and vector-graphics (Inkscape). Finally, the entire workflow on how to write and plan the figures of a scientific paper will be covered. Expected outcomes: at the end of the course students will be able to 1. design and create a multi-panel image from scratch. This includes the ability to: modify source images, including legends and diagrams; export data and plots as image files; organize the layout and assemble the figure 2. prepare scientific figures and illustration in agreement with editorial artwork-guidelines using the main tools (from the main palette) of Open Source software such as GIMP, Inkscape, for raster and vector image modification 3. design and export images in the correct format, with image properties optimized for a specific communication media (e.g. scientific paper, research project, oral presentations, poster) 4. Organize the text of a manuscript according to good storytelling rules.
modalità di accertamento finale: Da definire
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Corso di microscopia: modulo II
data presunta: 2028/2029 - tipologia: riconducibile al progetto formativo - modalità di erogazione: Ex-cathedra - numero ore: 8
docente del corso: Marcus Thelen qualifica: Professore affiliazione: Estera
programma delle attività: Il corso è rivolto agli studenti di questo Dottorato che abbiano già acquisito conoscenze relative alle tecniche di microscopia. Programma delle attività, applicazione della microscopia a fluorescenza: proteine fluorescenti, tag, fluorofori Ca2+, FRET, illuminazione strutturata, FLIM, FRAP, fotoattivazione e fotocommutazione, microscopia a 2 fotoni. Introduzione alla microscopia elettronica. Immagini digitali, analisi delle immagini con ImageJ / Cell profiler. Preparazione dei campioni immunoistochimici (IHC), protocolli di colorazione e migrazione cellulare. Microscopia multifotone, introduzione, preparazione dei tessuti, aspetti tecnici. Sono previste esercitazioni pratiche per un gruppo ristretto di studenti.
modalità di accertamento finale: valutazione delle competenze mediante test finale
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Scuola virtuale d'Immunologia
data presunta: Febbraio - Marzo 2029 - tipologia: riconducibile al progetto formativo - modalità di erogazione: Ex-cathedra - numero ore: 8
docente del corso: Ricercatori e Professori italiani e stranieri qualifica: Professore affiliazione: Estera
programma delle attività: Il corso consiste in una scuola virtuale d'immunologia organizzata dalla Società Italiana d'Immunologia, Immunologia Clinica e Allergologia (SIICA) che tratterà tematiche inerenti al ruolo del sistema immunitario in condizioni immunopatologiche e approcci innovativi d'immunoterapia.
modalità di accertamento finale: valutazione delle competenze mediante test finale.
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Parlare in pubblico
data presunta: 2028/2029 - tipologia: riconducibile al progetto formativo - modalità di erogazione: Ex-cathedra - numero ore: 4
docente del corso: qualifica: Studioso o esperto di aziende o istituzioni culturali o sociali affiliazione: Italiana
programma delle attività: Il corso è organizzato dal Dottorato in Genetica e Biologia Molecolare ed è aperto alle attività formative della Scuola BeMM. In questo corso si vogliono fornire ai dottorandə le basi di come ci si confronta coi giornalistə e coi mezzi di comunicazione di massa: che cosa cercano, chi sono i pubblici, come si possono raggiungere nel modo migliore, senza equivoci, senza conflitti, e magari con reciproca soddisfazione. Teoria e pratica dell’intervista: dalla carta stampata, alla radio, alla tv. Ma anche alcuni suggerimenti di scrittura e di comunicazione dal vivo per chi vuole fare da sé, senza troppi mediatori.
modalità di accertamento finale: Valutazione delle competenze acquisite mediante organizzazione di una presentazione orale.
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Career development plan for early stage researchers
data presunta: 2028/2029 - tipologia: riconducibile al progetto formativo - modalità di erogazione: Ex-cathedra - numero ore: 6
docente del corso: Alberto Boffi qualifica: Professore affiliazione: Italiana
programma delle attività: Il corso è rivolto agli studenti della Scuola di Dottorato in Biologia e Medicina Molecolare (BeMM) a cui questo Dottorato afferisce ed è organizzato dalla scuola di dottorato in Biochimica.
Il piano di sviluppo della carriera è una strategia strutturata e completa che gli individui creano per guidare la loro crescita e il loro avanzamento professionale. Comporta la definizione di obiettivi di carriera sia a breve che a lungo termine, l'identificazione delle competenze e delle conoscenze necessarie per raggiungere tali obiettivi e la definizione di azioni e traguardi specifici per raggiungerli. Un piano di sviluppo della carriera ben congegnato non solo aiuta gli individui a orientarsi nei loro percorsi di carriera, ma consente loro anche di prendere il controllo del loro sviluppo professionale. Questo approccio proattivo include autovalutazione, apprendimento continuo, networking e ricerca di opportunità per migliorare le competenze. Rivedendo e aggiornando regolarmente il piano, gli individui possono adattarsi alle circostanze mutevoli, capitalizzare le opportunità emergenti e rimanere allineati con le loro aspirazioni in evoluzione. In definitiva, un piano di sviluppo della carriera attentamente costruito funge da tabella di marcia per gli individui per realizzare il loro pieno potenziale e raggiungere un percorso professionale appagante e di successo. Il corso è dedicato ai ricercatori in fase iniziale, comprendenti studenti di dottorato e post-doc. Il corso è suddiviso in tre distinti argomenti: 1) Piano di Sviluppo della Carriera (CDP) per la carriera accademica (Università italiane), 2) CDP negli Enti di Ricerca (nazionali e internazionali), 3) CDP nel settore privato.
Course program (English): The career development plan is a structured and comprehensive strategy that individuals create to guide their professional growth and advancement. It involves setting both short-term and long-term career goals, identifying the necessary skills and knowledge required to achieve those goals, and outlining specific actions and milestones to reach them. A well-crafted career development plan not only helps individuals navigate their career paths but also empowers them to take control of their professional development. This proactive approach includes self-assessment, continuous learning, networking, and seeking opportunities for skill enhancement. By regularly reviewing and updating the plan, individuals can adapt to changing circumstances, capitalize on emerging opportunities, and stay aligned with their evolving aspirations. Ultimately, a thoughtfully constructed career development plan serves as a roadmap for individuals to realize their full potential and attain a fulfilling and successful professional journey. The course is dedicated to Early Stage Researchers, comprising PhD students and Post Docs. The course is divided in three separate topics: 1) Career Development Plan (CDP) for academic career (Italian Universities), 2) CDP in Research Institutions (National and international), 3) CDP in the private sector.
modalità di accertamento finale: Valutazione delle competenze mediante scrittura del proprio "Career Developmental Plan"
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From Cell to Animal Models: Guidelines and Best Practice
data presunta: 2028/2029 - tipologia: riconducibile al progetto formativo - modalità di erogazione: Ex-cathedra - numero ore: 16
docente del corso: Dott.ssa Tramutola, Prof. Di Domenico, Prof. Barone, Prof. Mangoni, Prof. Perluigi, Prof. Di Angelantonio, Prof. Sanchini, Prof. Basilico qualifica: Professore affiliazione: Italiana
programma delle attività: Il corso è organizzato dal dottorato in SCIENZE DELLA VITA ed e' un corso teorico-pratico in lingua inglese aperto alle attività formative della scuola BeMM. Il corso ha l’obiettivo di fornire una panoramica completa delle linee guida e delle migliori pratiche per l’utilizzo di modelli cellulari e animali in ambito scientifico e di ricerca. Gli studenti acquisiranno una conoscenza approfondita delle tecniche di coltura cellulare, della manipolazione genetica e dell’applicazione dei modelli animali negli studi biomedici. Modulo 1: Introduzione ai modelli cellulari e animali Basi della coltura cellulare: tecniche per il mantenimento e la proliferazione delle cellule. Principi fondamentali dell’etica nella ricerca che utilizza modelli animali. Vantaggi e limiti dei modelli cellulari e animali. Modulo 2: Coltura cellulare e manipolazione genetica Tecniche avanzate di coltura cellulare: linee cellulari stabili e cellule primarie. Principi di manipolazione genetica in vitro: trasfezione, trasduzione e CRISPR-Cas9. Discussione sull’impatto della manipolazione genetica in vitro sulla validità dei risultati. Modulo 3: Metodi in vitro e alternative avanzate alla sperimentazione animale Modelli di malattia umani derivati da iPSC biostampati in 3D o auto-assemblati. Analisi funzionale di organoidi 3D e costrutti biostampati (MEA, imaging del calcio, patch clamp). Modulo 4: Modelli animali nella ricerca biomedica Scelta del modello animale più appropriato in base alle domande di ricerca. Aspetti etici dell’utilizzo dei modelli animali e conformità alle normative vigenti. Valutazione dei parametri fisiologici nei modelli animali. Modulo 5: Progettazione di studi con modelli animali Protocolli sperimentali e pianificazione degli studi con modelli animali. Monitoraggio e raccolta dei dati nei modelli animali. Analisi statistica e interpretazione dei risultati. Modulo 6: Buone pratiche e prospettive future Linee guida internazionali per l’utilizzo dei modelli cellulari e animali. Casi di successo ed esempi applicativi nell’impiego dei modelli per la ricerca biomedica. Prospettive future: avanzamenti tecnologici e approcci innovativi.
modalità di accertamento finale: valutazione delle competenze mediante test finale.
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Analisi della transcriptomica spaziale: strumenti e strategie
data presunta: 2028/2029 - tipologia: riconducibile al progetto formativo - modalità di erogazione: Ex-cathedra - numero ore: 4
docente del corso: V. Fulci (Sapienza, Università di Roma) qualifica: Professore affiliazione: Italiana
programma delle attività: Saranno illustrati nel dettaglio gli step necessari per il preprocessing dei dati di Spatial Transcriptomics. Verranno inoltre presentati i principali strumenti per l’analisi e la caratterizzazione delle regioni tissutali, con attenzione alle differenze tra approcci “segmentation-free” e metodi basati su pseudo-cellule.
modalità di accertamento finale: valutazione delle competenze mediante test finale.
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