Dottorato in GENETICA E BIOLOGIA MOLECOLARE

Elenco dei corsi/attività primo anno

Eventuali maggiori informazioni per le voci sopra elencate L'offerta formativa per il primo anno è articolata in: (A) corsi organizzati dalla scuola di dottorato BeMM (6 per il primo anno di corso), (B) 2 cicli di seminari specificamente organizzati dal dottorato in Genetica e Biologia Molecolare (comuni anche agli altri anni di corso) (C) Altri seminari e corsi organizzati in collaborazione con altri enti ed istituzioni (tipicamente IBPM/CNR ed EMBL) la cui natura e numero non è programmabile (circa 10-15 seminari per AA) I dottorandi sono tenuti inoltre a partecipare, ogni due settimane, ad incontri in cui espongono l'avanzamento delle loro ricerche. INFORMAZIONI AGGIUNTIVE PER I CORSI E SEMINARI DEL PRIMO ANNO - Corso teorico-pratico in "Cellular microscopy and image analysis" (organizzato dal Dottorato in Genetica e Biologia Molecolare in collaborazione con CNR-IBPM, 1 CFU). Organizzatori/speakers: Giulia Guarguaglini, Patrizia Lavia, Lia Asteriti, Vincenzo Costanzo, Pietro Carigliano, Mario Guarracino. Planned: half-end May, 2022, IBPM laboratories c/o BBCD Department, via degli Apuli site. Corso rivolto anche ai dottorandi del II e III anno. - Corso "Alternative career in Science" (organizzato da Ass.ne giovanile Laboratorio11 in collaborazione con Dottorato in Genetica e Biologia Molecolare, 1 CFU). Aula Montalenti, Edificio Genetica (CU022), ore 17-20 nei giorni 5 maggio 2022 (Science communication tips), 9 giugno 2022 (Scientific illustration) e 7 luglio 2022 (Career in biotech company). - Corso in "Sperimentazione Animale" (organizzato dalla scuola BeMM, 1 CFU) date e modalità in via di definizione - Forum “New Frontiers in Regenerative Medicine” (organizzato dal dottorato MIT per la scuola BeMM) Speakers T. Rando, P. Munoz-Canoves, F. Protasi, M. Sampaolesi. 14 April, 2022. Link zoom inviato via email (rivolto anche a dottorandi del II e III anno) - Corso in "Sicurezza in laboratorio" (organizzato dalla scuola BeMM, 1 CFU) date e modalità in via di definizione - Corso in "Banche dati bibliografiche – cataloghi biblioteche - open access" (organizzato dalla scuola BeMM, 1CFU). Dottoressa Maria Squarcione. Date e modalità di erogazione da definire - Cicli di seminari organizzati dal dottorato GBM per i dottorandi dei tre anni (vedi anche voce seminari) Ciclo di seminari in “Cutting-edge molecular technologies: a Sapienza/EMBL joint effort to share complementary expertises” (I, II e III anno). Google Meet https://meet.google.com/cyp-skud-ped November 26, 2021, 14:00 Alvaro Crevenna (Head of Microscopy Facility Epigenetics and Neurobiology Unit EMBL Rome) “Imaging tissue across scales, from ultra-structure to spatial -omics” December 10, 2021, 14:00 Patrizia Lavia (CNR , IBPM Institute of Molecular Biology and Pathology) “Imaging in dynamic mode: real time analysis of living cells” January 21, 2022, 14:00 2022 Tiziana Santini (Sapienza, University of Rome, Department of Biology and Biotechnologies) “Imaging methodologies for RNA detection in cultured cells and tissues” February 18, 2022, 14:00 Neil Humphreys (Head of Gene Editing and Embryology Facility, EMBL, Rome) “Utilising CRISPR to create novel humanised mouse models” 04 March, 2022, 14:00 Julie Martone (Institute of Molecular Biology and Pathology, of National Council of Research, Rome) "How to unravel the mechanisms of action of lncRNAs" 18 March, 2022, 14:00 Jim Sawitzke (Head of Genetic & Viral Engineering Facility, EMBL, Rome) “The “why’s” and “how’s” of viral engineering and an advanced cloning method” April 01, 2022, 14:00 Logan Moran Mulroney/Camilla Ugolini (Istituto Italiano di Tecnologia, Milan) “Detecting modifications from long-read nanopore sequencing” May 13, 2022, 14:00 Pietro Laneve (IBPM-CNR) & Silvia Galfrè (Department of Biology and Biotechnologies "Charles Darwin") “Integrating multiple gene editing and single-cell RNA sequencing to reveal the function of complex non-coding loci in motor neuron differentiation” June 17, 2022, 14:00 Alessandro Vannini (Head of Structural Biology Research Centre, Human Technopole, Milan) "Modern integrative structural biology to study structure and function of the eukaryotic genome” Ciclo di seminari in "controllo genetico della divisione cellulare" Aula serra 1, Edificio di Genetica (CU022), date: 1/7/2022, 15/7/2022, 9/9/2022, 23/9/2022, 7/10/2022, 21/10/2022. Organizzato da Prof. Patrizio Dimitri, speakers in via di definizione. Modalità di scelta del soggetto della tesi La tesi viene scelta nell'ambito delle tematiche proprie del corso di dottorato e delle competenze scientifiche assicurate dal collegio dei docenti. Ogni anno, prima del concorso di ammissione, i docenti del corso di dottorato propongono delle linee di ricerca specifiche che vengono pubblicate sul sito web del dottorato. Modalità delle verifiche per l'ammissione all'anno successivo Ciascun dottorando del primo anno presenta l'attività svolta mediante un seminario in lingua inglese davanti al collegio dei docenti, ai docenti guida e ai tutors, nei mesi di luglio-settembre. Per l'ammissione all'anno successivo si tiene anche conto della partecipazione del dottorando alle attività didattiche del corso di dottorato GBM e della Scuola di dottorato BeMM. A questo fine, ogni dottorando è munito di un libretto delle presenze che viene firmato dai relatori.

Elenco dei corsi/attività secondo anno

Eventuali maggiori informazioni per le voci sopra elencate L'offerta formativa per il secondo anno è articolata in: (A) corsi organizzati dalla scuola di dottorato BeMM (6 per il secondo anno di corso), (B) Cicli di seminari specificamente organizzati dal dottorato in Genetica e Biologia Molecolare (2 cicli comuni anche agli altri anni di corso, l'elenco dei seminari è riportato alla voce Seminari); (C) Altri seminari e corsi organizzati in collaborazione con altri enti ed istituzioni (tipicamente IBPM/CNR ed EMBL) la cui natura e numero non è programmabile (circa 10-15 seminari per AA) I dottorandi sono tenuti inoltre a partecipare, ogni due settimane, ad incontri in cui espongono l'avanzamento delle loro ricerche. INFORMAZIONI AGGIUNTIVE PER I CORSI E SEMINARI DEL SECONDO ANNO - Corso in "Fundamentals of Enzyme Kinetics" (organizzato dalla scuola BeMM, 1 CFU) Docenti: Roberto Contestabile, Francesco Malatesta & Serena Rinaldo; 24 febbraio 2022-4 marzo 2022 - zoom link: https://uniroma1.zoom.us/j/87660761186?pwd=OEVrT0N0YTZYR3hPNDJnQVhRT0NhQT09 Meeting ID: 876 6076 1186 Passcode: 515696 - Corso in "Artwork for scientific papers" (organizzato dalla scuola BeMM, 2 CFU) 6 & 13 May, 2022, 2:00 pm; registration: https://forms.gle/wxodw4RyzJCUkAe78; details at https://phd.uniroma1.it/dottorati/cartellaDocumentiWeb/c5c27970-467e-4fdf-a738-8a0f407a9d8c.pdf - Corso in “Single-cell transcriptomics”, theory and bioinformatic pipeline (organizzato dalla scuola BeMM, 2 CFU), Docente: Prof. Valerio Fulci. 12-13,18,20 July 2022 - Corso in “Biostatistica” (organizzato dal dottorato BCS per la scuola BeMM, 2 CFU), ottobre 2022, date precise e modalità da definire. Docenti: Mario Fordellone e Valerio Licursi - Corso in "Drug Discovery & Delivery" (organizzato dalla scuola BeMM, 2 CFU) date e modalità da definire - Corso in Bioinformatics: Theory and Applications from Genomes to Drugs (organizzato dalla scuola BeMM, 3 CFU) date e modalità da definire - Corso in "Misconducting Research Integrity" (organizzato dalla scuola BeMM, 1 CFU) date e modalità da definire - Corso in Single-cell transcriptomics, theory and bioinformatic pipeline (organizzato dalla scuola BeMM, 2 CFU), Teacher Prof. Valerio Fulci. 12-13,18,20 July 2022 - Cicli di seminari organizzati dal dottorato GBM per i dottorandi dei tre anni (vedi anche voce seminari) - Ciclo di seminari in “Cutting-edge molecular technologies: a Sapienza/EMBL joint effort to share complementary expertises” (I, II e III anno). Google Meet https://meet.google.com/cyp-skud-ped November 26, 2021, 14:00 Alvaro Crevenna (Head of Microscopy Facility Epigenetics and Neurobiology Unit EMBL Rome) “Imaging tissue across scales, from ultra-structure to spatial -omics” December 10, 2021, 14:00 Patrizia Lavia (CNR , IBPM Institute of Molecular Biology and Pathology) “Imaging in dynamic mode: real time analysis of living cells” January 21, 2022, 14:00 2022 Tiziana Santini (Sapienza, University of Rome, Department of Biology and Biotechnologies) “Imaging methodologies for RNA detection in cultured cells and tissues” February 18, 2022, 14:00 Neil Humphreys (Head of Gene Editing and Embryology Facility, EMBL, Rome) “Utilising CRISPR to create novel humanised mouse models” 04 March, 2022, 14:00 Julie Martone (Institute of Molecular Biology and Pathology, of National Council of Research, Rome) "How to unravel the mechanisms of action of lncRNAs" 18 March, 2022, 14:00 Jim Sawitzke (Head of Genetic & Viral Engineering Facility, EMBL, Rome) “The “why’s” and “how’s” of viral engineering and an advanced cloning method” April 01, 2022, 14:00 Logan Moran Mulroney/Camilla Ugolini (Istituto Italiano di Tecnologia, Milan) “Detecting modifications from long-read nanopore sequencing” May 13, 2022, 14:00 Pietro Laneve (IBPM-CNR) & Silvia Galfrè (Department of Biology and Biotechnologies "Charles Darwin") “Integrating multiple gene editing and single-cell RNA sequencing to reveal the function of complex non-coding loci in motor neuron differentiation” June 17, 2022, 14:00 Alessandro Vannini (Head of Structural Biology Research Centre, Human Technopole, Milan) "Modern integrative structural biology to study structure and function of the eukaryotic genome” - Ciclo di seminari in "controllo genetico della divisione cellulare" Aula serra 1, Edificio di Genetica (CU022), date: 1/7/2022, 15/7/2022, 9/9/2022, 23/9/2022, 7/10/2022, 21/10/2022. Organizzato da Prof. Patrizio Dimitri, speakers in via di definizione. Modalità di preparazione della tesi Oltre alla frequenza delle attività didattiche il dottorando svolge il lavoro sperimentale in laboratorio, supervisionato sia dal Docente Guida che dal Tutor esterno. Durante i progress report (in inglese) il Collegio dei Docenti ha modo di intervenire nell'avanzamento del lavoro e di poter suggerire, se necessario, delle modifiche. Modalità delle verifiche per l'ammissione all'anno successivo Il Collegio dei Docenti giudica il lavoro svolto dal dottorando che viene presentato al consesso tramite un seminario in lingua inglese. Per l'ammissione all'anno successivo si tiene anche conto della partecipazione del dottorando alle attività didattiche del corso di dottorato GBM e della Scuola di dottorato BeMM. A questo fine, ogni dottorando è munito di un libretto delle presenze che viene firmato dai relatori.

Elenco dei corsi/attività terzo anno

Eventuali maggiori informazioni per le voci sopra elencate L'offerta formativa per il terzo anno è articolata in: (A) corsi organizzati dalla scuola di dottorato BeMM (5 per il terzo anno di corso), (B) Cicli di seminari specificamente organizzati dal dottorato in Genetica e Biologia Molecolare (2 cicli comuni anche agli altri anni di corso); (C) Altri seminari e corsi organizzati in collaborazione con altri enti ed istituzioni (tipicamente IBPM/CNR ed EMBL) la cui natura e numero non è programmabile (circa 10-15 seminari per AA) I dottorandi sono tenuti inoltre a partecipare, ogni due settimane, ad incontri in cui espongono l'avanzamento delle loro ricerche. INFORMAZIONI AGGIUNTIVE PER I CORSI E SEMINARI DEL TERZO ANNO - Corso in "Public speaking" (organizzato dal dottorato GBM per la scuola BeMM, 1 CFU), Dr.ssa Anna Mazzotti, Aula Montalenti, Edificio Genetica (CU022), 9 settembre 2022 ore 10-18 - Corso in “Comunicazione Scientifica” (organizzato dal dottorato GBM per la scuola BeMM, 1 CFU) Dr.ssa Silvia Bencivelli, giornalista scientifica, Aula Montalenti, Edificio Genetica (CU022), 16 settembre 2022 ore 10-18 - Corso in "Practical approaches of human genomics / metagenomics of human microbiota" (organizzato dalla scuola BeMM, 1 CFU). Speakers Viviana Caputo, Valerio Fulci, Claudia Carissimi. Ottobre 2022. Date precise e modalità di erogazione da definire. - BeMM symposium (organizzato dai dottorandi della scuola BeMM, 1 CFU). Il Convegno della scuola BeMM si tiene tipicamente nei mesi autunnali, viene organizzato dai dottorandi del terzo anno dei corsi di dottorato afferenti alla scuola ed è rivolto a tutti i dottorandi e docenti dei corsi di dottorato afferenti alla scuola. - Corso in "Spin off - Start up" (organizzato dalla scuola BeMM, 1 CFU) date e modalità da definire - Corso in "MSCA actions" (organizzato dalla scuola BeMM, 1 CFU) date e modalità da definire - Ciclo di seminari in “Cutting-edge molecular technologies: a Sapienza/EMBL joint effort to share complementary expertises” (I, II e III anno). Google Meet https://meet.google.com/cyp-skud-ped November 26, 2021, 14:00 Alvaro Crevenna (Head of Microscopy Facility Epigenetics and Neurobiology Unit EMBL Rome) “Imaging tissue across scales, from ultra-structure to spatial -omics” December 10, 2021, 14:00 Patrizia Lavia (CNR , IBPM Institute of Molecular Biology and Pathology) “Imaging in dynamic mode: real time analysis of living cells” January 21, 2022, 14:00 2022 Tiziana Santini (Sapienza, University of Rome, Department of Biology and Biotechnologies) “Imaging methodologies for RNA detection in cultured cells and tissues” February 18, 2022, 14:00 Neil Humphreys (Head of Gene Editing and Embryology Facility, EMBL, Rome) “Utilising CRISPR to create novel humanised mouse models” 04 March, 2022, 14:00 Julie Martone (Institute of Molecular Biology and Pathology, of National Council of Research, Rome) "How to unravel the mechanisms of action of lncRNAs" 18 March, 2022, 14:00 Jim Sawitzke (Head of Genetic & Viral Engineering Facility, EMBL, Rome) “The “why’s” and “how’s” of viral engineering and an advanced cloning method” April 01, 2022, 14:00 Logan Moran Mulroney/Camilla Ugolini (Istituto Italiano di Tecnologia, Milan) “Detecting modifications from long-read nanopore sequencing” May 13, 2022, 14:00 Pietro Laneve (IBPM-CNR) & Silvia Galfrè (Department of Biology and Biotechnologies "Charles Darwin") “Integrating multiple gene editing and single-cell RNA sequencing to reveal the function of complex non-coding loci in motor neuron differentiation” June 17, 2022, 14:00 Alessandro Vannini (Head of Structural Biology Research Centre, Human Technopole, Milan) "Modern integrative structural biology to study structure and function of the eukaryotic genome” - Ciclo di seminari in "Genetic control of cell division", Aula serra 1, Genetics building (CU022), 1/7/2022, 15/7/2022, 9/9/2022, 23/9/2022, 7/10/2022, organizzato da Prof Patrizio Dimitri, speakers tba. Modalità di ammissione all'esame finale Nel mese di ottobre dell'ultimo anno, alla presenza del Docente Guida e del Tutor, il dottorando espone al Collegio dei Docenti il lavoro svolto nei tre anni precedenti. La presentazione avviene in forma di seminario, in lingua inglese, della durata di trenta minuti. A seguire c'è un dibattito in cui il dottorando deve rispondere a domande poste dal Collegio Docenti, dal Docente Guida e dal Tutor. Il Collegio Docenti, presa visione dell'attività didattica seguita dal dottorando, del numero di congressi e corsi seguiti, del numero di pubblicazioni e della posizione occupata in queste, esprime un giudizio collegiale sull'insieme del lavoro svolto dal dottorando. Le tesi sono valutate da due revisori esterni che suggeriscono eventuali correzioni e valutano l'idoneità a sostenere l'esame finale Modalità di svolgimento dell'esame finale L'esame finale si svolge normalmente nel mese di febbraio successivo alla fine del corso di dottorato. La Commissione dell'esame finale riceve circa un mese prima gli elaborati dei singoli candidati in forma elettronica. L'elaborato è scritto in lingua inglese ed è firmato per accettazione sia dal Docente Guida che dal Tutor. L'esame finale consiste in un seminario, con supporto di PowerPoint, sul lavoro svolto. Il tempo concesso è di trenta minuti più la discussione. La Commissione esprime un giudizio che tiene conto sia della presentazione del lavoro svolto che del resto del curriculum formativo e scientifico del candidato.