Ricerca: Il ruolo del microbiota nel cancro del tratto urinario
TITOLO DELLA RICERCA: Il ruolo del microbiota nel cancro del tratto urinario.
THEMATIC AREA: Biologia molecolare
SSD: BIO/10
FORMAZIONE SCOLASTICA
• Immatricolati al corso di Dottorato di Ricerca – Scienze della Vita - 37° ciclo (2021/2022)
Dipartimento Ospitante – Dipartimento di Scienze e Biotecnologie medico-chirurgiche (Latina), Italia
• 2015-2017: Master in Zoologia – PMAS Arid Agriculture University Rawalpindi, Pakistan
• 2011-2015: Laurea in Zoologia - Università di Sargodha, Pakistan
ESPERIENZE NELL'INSEGNAMENTO E NELLA RICERCA
• Docente (vistatore) presso il Dipartimento di Zoologia, Università di Sargodha, Sargodha, Pakistan. (03/09/2018 - 16/09/2021).
• Tirocinio per tesi magistrale: su “Epizootiology of Skin Disease in a Fish Species from River Swat” (primavera 2017). Lo studio è stato condotto su Labeo rohita raccolto dal fiume Swat a Khyber Pakhtunkhwa. Si è scoperto che i pesci malati erano infetti da Flavobacterium columnare. Ho raccolto sangue e tessuti cutanei da pesci sia sani che malati per studi ematologici e istopatologici. Sono state osservate la pelle e le branchie di pesci sani e malati infetti da F. columnare; i risultati ottenuti hanno mostrato che F. columnare non solo influenza la morfologia dei pesci (pelle e branchie) ma ha anche un effetto significativo sull'istologia delle specie colpite.
• Stage presso Ministero dei Cambiamenti Climatici, Governo del Pakistan, Islamabad, Pakistan. (2016, 6 mesi).
SUL PROGETTO
In questo progetto di ricerca, miriamo ad affrontare l’intricata relazione tra l’urobioma e il cancro della vescica, una malattia classificata come il decimo cancro più diagnosticato a livello globale. Il cancro alla vescica, con circa 573.000 nuovi casi e 213.000 decessi nel 2020, presenta tassi di incidenza variabili nelle diverse regioni. Studi recenti evidenziano la presenza di una comunità microbica diversificata nel tratto urinario sano, sollevando interrogativi sul suo ruolo nello sviluppo del cancro. I nostri obiettivi comprendono la comprensione dei fattori microbici che influenzano uno stato di salute rispetto agli indicatori di patologia, in particolare nelle donne, e il contributo allo sviluppo di interventi innovativi e biomarcatori per il cancro della vescica. Il progetto prevede l'utilizzo di metodologie avanzate, tra cui coltura urinaria quantitativa espansa, crescita batterica anaerobica, amplificazione PCR dell'rRNA 16S e analisi metagenomica. Studiando il microbioma della vescica, cerchiamo di identificare potenziali biomarcatori per il cancro della vescica in stadio iniziale, aprendo la strada a migliori screening, diagnosi e strategie terapeutiche. Questa ricerca è fondamentale per far avanzare la nostra comprensione dell’impatto dell’urobioma sulla salute della vescica e colmare le lacune negli attuali approcci diagnostici e terapeutici.
SEMINARI
• Emerging role for m6A RNA modification in cancer: learning from leukemia
Alessandro Fatica Dept. Biology and Biotechnology Sapienza
11/03/2022
• Functional and Pathological Interactions of α synuclein
Alfonso De Simone Department of Pharmacy, University of Naples Federico II
18/03/2022
• Amino acid metabolism: involvement in tumor progression and new therapeutic approaches
Alessio Paone (Dept Biochemical Sciences, Sapienza University of Rome)
25/03/2022
• Mechanism of a cell wall transporter involved in lipoteichoic acid synthesis and bacterial adaptation
Camilo Perez. Biozentrum, Basel, CH
01/04/2022
• Evolution of Klebsiella pneumoniae high-risk clones to pan-resistance
Alessandra Carattoli Dept. Molecular Medicine Sapienza University of Rome
08/04/2022
• Architecture of the human erythrocyte ankyrin-1 complex
Francesca Vallese Dept. of Anesthesiology Columbia University, New York, USA
22/04/2022
• Metabolic control of T cell immunity
Dott. Mauro Corrado, CECAD center, University of Cologne (Germany)
29/04/2022
• RNA-based therapeutic approaches for neurodegenerative tauopathies
Michela A. Denti University of Trento
06/05/2022
• When viral RNA met the cell: a story of protein-RNA interactions
Alfredo Castello MRC-University of Glasgow Centre for Virus Research (UK)
12/05/2022
• NADPH Oxidase: Structure, Enzymology and Drug Design
Andrea Mattevi Department of Biology and Biotechnology University of Pavia, Italy
20/05/2022
• Mechanisms of ligand binding
Enrico Di Cera Edward A. Doisy Department of Biochemistry and Molecular Biology, Saint Louis University School of Medicine, St. Louis, USA
27/05/2022
• Protective / Preventive Role of Natural Compounds in Human Health: Biochemical Approaches To Target Ageing and Neurodegeneration
Silvana Hrelia and Cristina Angeloni University of Bologna
01/06/2022
• Fundamental of enzyme kinetics (3rd Edition)
Teachers: Roberto Contestabile, Francesco Malatesta & Serena Rinaldo (Sapienza)
24-25-28/02/2022
• Engineering Proteins To Boost LTP And Memory
Prof. Cristian Ripoli Department of Neuroscience of Università Cattolica del Sacro Cuore– Fondazione Policlinico Universitario A. Gemelli IRCCS, Rome
03/03/2023
• Application of deep learning to the protein structure prediction: the tale of a “gigantic leap”
Prof. Anna Marabotti Department of Chemistry and Biology "A. Zambelli" University of Salerno
09/03/2023
• Deciphering self-renewal traits in epidermal stem cells
Dott. Elena Enzo Centre for Regenerative Medicine ‘‘Stefano Ferrari’’, University of Modena and Reggio Emilia
17/03/2023
• Insulin Signaling in Alzheimer’s Disease Brain and Models Thereof
Prof. Eugenio Barone Department of Biochemical Sciences -Sapienza University
23/03/2023
• Educating tutor-associate macrophages under metabolic stress
Dr. Ping-Chih Ho Department of Fundamental Oncology & Ludwig Institute for Cancer Research University of Lausanne, Switzerland
30/03/2023
• Synthetic Biology: what, why and how
Dott.ssa Velia Siciliano Synthetic and Systems Biology for Biomedicine Istituto Italiano di Tecnologia-IIT
14/04/2023
• Protecting our genome: mechanisms to maintain DNA repeats stability in human cells
Prof. Simona Giunta Department of Biology and Biotechnology Charles Darwin, Sapienza University of Rome, Italy
21/04/2023
• The chaperonin GroEL nano-machine: allostery and function
Prof. Amnon Horowitz Department of Chemical and Structural Biology Weizmann Institute of Science Rehovot, Israel
12/05/2023
• The axonal transport machinery and its dysfunctions in neurodegenerative diseases
Prof. Giampietro Schiavo Department of Neuromuscular Diseases, UCL Queen Square Institute of Neurology Dementia Research Institute, University College London, London
19/05/2023
CORSI
• CIVIS Masterclass in CV & cover letters
Masterclass in CV and Cover letters (University of Glasgow)
08/02/2022
• Preparing Artwork for scientific papers
Giorgio Giardina and Stefano Gianni (Sapienza)
06 and 13/05/2022
• Microscopy Techniques for the Life Sciences
From Ramon y Cajal to CryoEM Course for Advanced Microscopy
Sapienza University of Rome
30-31/01/2023
• Workshop on bulk RNA-seq
The Marseille Rare Diseases institute – MarMaRa
Aix-Marseille University
22/06/2023
WEBINARS AND WORKSHOP
• CIVIS Webinar
Dysbiosis in Inflammatory Bowel Disease: Role of the microbiota in the pathophysiology of the disease
Laila Aldars (UAM) and Claire Liefferinckx (ULB)
14/04/2022
• Online CIVIS Workshop
Microbiota-related Research Tools
- Methodological aspects in the study of the microbiota and Inflammatory Bowel Disease
Laila Aldars and Sebastian Mas-Fontao (UAM)
- Data analysis and statistical approach in microbiota research
Gratiela Gradisteanu (UB)
4/05/2022
• Hands-on Training in Tick Identification, Department of Parasitology, University of Veterinary and Animal Sciences Lahore, Pakistan
27/12/2021
• Indigenous Faculty Development Program for Enhancing Teaching Skills of University Teachers, at the Committee Hall, Office of the Vice Chancellor, Sargodha University, Pakistan.
27/11/2019
SCUOLA ESTIVA, ROMANIA
University of Bucharest
Single-cell approaches and omics / exploring the emerging role of the host microbiome in tumor heterogeneity.
Una Summer School organizzata dai membri dell'Alleanza CIVIS per la quale sono stata selezionata e vincitrice di una borsa di mobilità.
11/07/2022 – 16/07/2022
PROGETTI COLLATERALI
• Construction of EPEC double gadC mutant strain to unveil the role of the two gadC genes.
• The Glutaminase-Dependent Acid Resistance System in Enteric Bacteria.
PUBBLICAZIONI
• Tahir, H. M., Yaqoob, R., Akhtar, U., Ahmed, K., Sharif, W.R., Zaffar, A., Ghaffar, M. and Mahboob, M. (2014). Toxicity and avoidance behaviour of Coccinella septempunctata (Coleoptera: Coccinellidae) against deltamethrin. Biologia (Pakistan), 60(2), 305-307
• Tahir, H.M., Naseem, S., Zahra, K., Akhtar, U., Mumtaz, R., Khalid, R. and Nouman, M. (2015). Autotomy: An important tool in spiders to avoid life threatening situations. Biologia (Pakistan) 61(2), 329-333.
• Siddique, F., Arshad, M., Hassan, W., Shah, Z. H. and Akhtar, U. (2020). A review on Chitosan: As a potent fish preservative. International Journal of Biosciences, 16(4), 90-101