Dottorato in BIOLOGIA CELLULARE E DELLO SVILUPPO

email: simone.ferrari@uniroma1.it
telefono: +39 0649912454
edificio: CU022 - Botanica
stanza: 23

Simone Ferrari, Ph.D.
Professore di Prima Fascia, SSD BIO/04 Fisiologia Vegetale, Dipartimento di Biologia e Biotecnologie "Charles Darwin", Sapienza Università di Roma, Edificio CU022, Piazzale Aldo Moro, 5 00185 Roma
Telefono: +39-0649912454; Fax: +39-0649912446
E-mail: simone.ferrari@uniroma1.it
ORCID ID: 0000-0002-1389-2090
SCOPUS ID: 7201818434

EDUCAZIONE

27-3-2002 Dottorato di Ricerca in Scienze Botaniche conseguito presso il Dipartimento di Biologia Vegetale dell'Università degli Studi “La Sapienza”, Roma. Titolo della tesi: “Role of Polygalacturonase-Inhibiting Proteins in the Arabidopsis thaliana-Botrytis cinerea Interaction”.
21-5-1997 Laurea in Scienze Biologiche, Ind. Biomolecolare, con la votazione di 110/110 con lode presso l'Università degli Studi “La Sapienza”, Roma. Titolo della tesi: “Isolamento di nuovi mutanti di Arabidopsis thaliana mostranti alterata direzione di crescita della radice”.

INCARICHI DI RICERCA

2022-presente Professore di I Fascia in Fisiologia Vegetale (BIO/04), Dipartimento di Biologia e Biotecnologie “Charles Darwin”, Sapienza Università di Roma.
2017-2022 Professore di II Fascia in Fisiologia Vegetale (BIO/04), Dipartimento di Biologia e Biotecnologie “Charles Darwin”, Sapienza Università di Roma.
2010-2017 Ricercatore Universitario in Fisiologia Vegetale (BIO/04), Dipartimento di Biologia e Biotecnologie “Charles Darwin”, Sapienza Università di Roma.
2007-2010 Ricercatore Universitario in Fisiologia Vegetale (BIO/04), Dipartimento di Biologia Vegetale, Sapienza Università di Roma.
2007 Visiting scientist, Max Planck Institute for Plant Breeding Research, Colonia (Germany)
2004-2007 Ricercatore Universitario in Patologia Vegetale (AGR/12), Dipartimento Territorio e Sistemi Agro-forestali, Università degli Studi di Padova.
2004 Visiting scientist, Department of Molecular Biology, Massachusetts General Hospital (Boston, MA, USA)
2003 Assegno di ricerca, Dipartimento di Agrobiologia e Agrobiochimica, Università degli Studi della Tuscia.
1999-2003 Research fellow in Molecular Biology, Faculty of Genetics, Harvard Medical School and Department of Molecular Biology, Massachusetts General Hospital (Boston, MA, USA).

Periodi di studio e ricerca in qualificate istituzioni di ricerca internazionali

1-2/2007 Max Planck Institute for Plant Breeding Research, Colonia (Germania)
7-8/2004 Department of Molecular Biology, Massachusetts General Hospital, Boston, MA (USA)
8/1999-2/2003 Department of Molecular Biology, Massachusetts General Hospital, Boston, MA (USA)

Borse di studio

2007 EMBO Short Term Fellowship (ASTF 5-2007) conferita dall’European Molecular Biology Organization.
2002 Borsa di studio annuale per ricerche all’estero, conferita dall’Istituto Pasteur-Fondazione Cenci Bolognetti.
2001 Borsa di studio annuale per corsi di formazione all’estero, conferita dall’Università degli Studi di Roma “La Sapienza”.
1998-2001 Borsa di Studio per studenti di Dottorato di Ricerca in Scienze Botaniche presso il Dipartimento di Biologia Vegetale dell'Università degli Studi di Roma “La Sapienza”.

Ha ottenuto nel 2014 l’Abilitazione Scientifica Nazionale (tornata 2012) per i settori 05/A2 (Prima) e 07/D1 (Prima), con tre parametri superati per entrambe le fasce in entrambi i settori (validità fino al 31/1/2023). Il 15-1-20 ha ottenuto nuovamente l’ASN (tornata 2018) per il settore 05/A2 (Prima fascia), con validità fino al 15-1-2029. Per quest’ultima ha superato i tre parametri soglia sia per i candidati che per i commissari, secondo simulazione IRIS.

PROGETTI DI RICERCA

Nel corso degli anni, il sottoscritto si è occupato di diversi aspetti della fisiologia vegetale, affrontandoli con approcci di tipo genetico, biochimico e molecolare. In particolare, le principali tematiche di ricerca sono state le seguenti:

- meccanismi fisiologici e molecolari che regolano la direzione di crescita degli organi vegetali, con particolare attenzione al ruolo dell’auxina nei processi di gravitropismo e circumnutazione della radice;
- basi molecolari delle risposte di difesa delle piante contro i patogeni, ed in particolare del ruolo degli inibitori proteici delle poligalatturonasi e degli elicitori pectici nella resistenza ai patogeni, e dei recettori della famiglia LysM-RLK nell’immunità innata di Arabidopsis thaliana;
- ruolo della parete cellulare, ed in particolare della sua componente pectica, nei processi di crescita, sviluppo e difesa delle piante;
- sviluppo di soluzioni biotecnologiche per migliorare la resistenza delle piante ai microrganismi patogeni e per aumentare l’efficienza di conversione delle biomasse lignocellulosiche in carburanti ed altri prodotti di interesse industriale.

1. Progetti di ricerca finanziati come coordinatore o responsabile di unità di ricerca
(tra parentesi: importo assegnato all’unità)

2023 Progetto “ELIA (ELIcitors from Agri-food and algal waste biomasses): bioconversion of waste into products for sustainable crop protection”, bando Progetti di Ricerca 2022 - Progetti Medi, Sapienza Università di Roma (€ 10.000)
2023 Progetto “Sistemi produttivi agroalimentari multifunzionali, innovativi e sostenibili per lo sviluppo delle aree marginali”, bando Centro Nazionale di Ricerca - Agritech (EU Next-GenerationEU - PIANO NAZIONALE DI RIPRESA E RESILIENZA (PNRR) – MISSIONE 4 COMPONENTE 2, INVESTIMENTO 1.4 – D.D. 1032 17/06/2022, CN00000022) (€1,121,525) (Co-PI)
2022 RTDA PON
2021 Progetto n A0375-2020-36720 “Utilizzo alternativo degli scarti agroalimentari in un contesto di economia circolare” finanziato nell’ambito del bando Progetti di Gruppi di Ricerca 2020 (Lazioinnova) (€39,860).
2019 Progetto di Ateneo "Ricerche Universitarie 2019" n. RM11916B6F156C03 dal titolo “Priming of defense responses in the trade-off between plant immunity and growth” (Sapienza Università di Roma) (€14,500).
2018 Progetto “Carburanti alternativi per l’aviazione civile” finanziato dall’Ente Nazionale per l’Aviazione Civile (€635,560) – coordinatore nazionale.
2018 Progetto “Un approccio glocal alle bioraffinerie di terza generazione” nell’ambito del progetto competitivo “Network-CIB: Catalisi dell’Innovazione nelle biotecnologie” finanziato dal MIUR ex Bando per finanziamento progetti competitivi di Consorzi Interuniversitari di ricerca ex D.M. 1049 dd 29/12/18 (€15,000).
2018 Progetto PON 2017 “ORIGAMI - Bioraffineria integrata per la produzione di biodiesel da microalghe” finanziato dal MIUR nell’ambito dell’avviso per la presentazione di progetti di ricerca industriale e sviluppo sperimentale nelle 12 aree di specializzazione individuate dal PNR 2015-2020, progetto n. ARS01_00881 (€203,000).
2016 Progetto di Ateneo "Ricerche Universitarie 2015" n. C26A15CFKE dal titolo "Role of an Arabidopsis thaliana LysM protein in the innate immunity" (Sapienza Università di Roma) (€8,000).
2015 Progetto ERA-Net “SIPIS: Decoding ligand-receptor specificities of LysM-proteins in plant immunity and symbiosis”, presentato nell’ambito del bando ERA-CAPS 2014-second call (€298,900).
2010 Progetto di Ateneo "Ricerche Universitarie 2010" dal titolo "Miglioramento della produzione di biocarburanti tramite alterazione della componente pectica della parete cellulare vegetale" (Sapienza Università di Roma) (€31,500).
2009 Finanziamento CRUI-MIUR COLLABORAZIONE ITALO-BRITANNICA PER GIOVANI RICERCATORI 2009-2010 dal titolo “Tailoring the composition of cell wall polymers to improve processing of biomass” (CRUI-British Council) (€5,000)
2006 Progetto PRIN 2006 “Basi molecolari della resistenza basale e indotta contro Botrytis cinerea in genotipi diversi di vite (Vitis vinifera)” (€60,000)

2. Partecipazione ad altri progetti di ricerca
2011 Progetto “FUELPATH: Exploiting the saccharification potential of pathogenic microorganisms to improve biofuel production from plants”, finanziato dall’European Research Council. Responsabile scientifico: Prof. Felice Cervone (Sapienza Università di Roma)
2010 Progetto “BIOMASSVAL: Miglioramento dell’utilizzo e digeribilità dei residui di coltivazione in relazione alla conversione in biocarburanti”, finanziato dal Ministero delle Politiche Agricole, Alimentari e Forestali. Responsabile scientifico: Prof. Felice Cervone (Sapienza Università di Roma)
2006 Programma di Ricerca Ex-60% "Proprietà delle poligalatturonasi secrete dalle specie di Fusarium del complesso Gibberella fujikuroi”, Responsabile scientifico: Prof. Francesco Favaron (Università di Padova).
2005 Programma di Ricerca Ex-60% "Caratterizzazione di geni pg di specie di Fusarium appartenenti al complesso Gibberella fujikuroi". Responsabile scientifico: Prof. Francesco Favaron (Università di Padova).
2004 Progetto di Ricerca d’Ateneo “Proteomica delle interazioni pianta-microrganismi-suolo”. Coordinatore: Prof. Andrea Squartini (Università di Padova).

N.B.: Nei progetti FUELPATH e BIOMASSVAL, ha contribuito in maniera preponderante alla stesura del programma di ricerca, al coordinamento delle attività, alla preparazione delle relazioni scientifiche e finanziare e alla gestione amministrativa del progetto stesso. Nel caso del progetto FUELPATH, è stato contact person ufficiale.

4. Altri finanziamenti alla ricerca
2006 Responsabile scientifico di una convenzione con CNR – Istituto di Cristallografia nell’ambito del Progetto UE n. 23044 NUTRA-SNACKS (€50,000)


ACCORDI DI RICERCA

2022 Identificazione e caratterizzazione di elicitori e biostimolanti da biomasse agricole mediante trattamento con basidiomiceti, Monsanto Agricoltura Italia Spa


PREMI E RICONOSCIMENTI

2020 Premio A. Baccarini-Melandri conferito dalla Società Italiana di Biologia Vegetale


PUBBLICAZIONI E BREVETTI

Indici bibliometrici (secondo Scopus)

H-index complessivo: 27
Citazioni complessive: 3911
Numero complessivo pubblicazioni: 47, di cui ISI: 37.
VQR 2011-14: 3 pubblicazioni su 3 presentate con punteggio massimo (1,0)
VQR 2015-19: 4 pubblicazioni presentate, 3 valutate in classe A ed una in classe B (punteggio totale: 116/120)


Brevetti

1. Cervone F, De Lorenzo G, Bellincampi D, Ferrari S, Lionetti V, Salvi G, Francocci, F (2014) “Use of plants with reduced levels of de-esterified homogalacturonan in the cell wall or portions thereof for improving the saccharification of plant biomasses”, brevetto USA n. US8637734B2.
2. Cervone F, De Lorenzo G, Ferrari S, Benedetti M, Pontiggia D (2018) “Fusion protein and transgenic plant expressing said protein”, Sapienza Università di Roma. Brevetto USA n.US20180002705A1

ATTIVITA' EDITORIALE E DI REVISORE
- Revisore per le riviste internazionali Genes and Development, Plant Cell, Plant Physiology, The Plant Journal, Molecular Plant-Microbe Interactions, Planta, BMC Research Notes, Journal of Plant Physiology, New Biotechnology, New Phytologist, Frontiers in Plant Science.
- Revisore di progetti di ricerca per National Science Foundation (USA); BARD - The US-Israel Agricultural Research & Development Fund (Israele); Agence Nationale de la Recherche (Francia); Austrian Science Fund (Austria); Swiss National Science Foundation, Università degli Studi di Verona.
- Editor del numero speciale di Plants “The Role of Cell Wall in Plant Defense" (2020).
- Editor del numero speciale di Journal of Pathogens “Molecular and Biochemical Interactions between Plants and Phytopathogenic Fungi and Oomycetes” (2011).
- Editor del numero speciale di Phytochemistry in onore di Paul G. Bolwell (2014).
- Dal 2015 è Associate Editor della rivista Frontiers in Plant Science