SERENA ROSIGNOLI

Dottoranda

ciclo: XXXVII
email: serena.rosignoli@uniroma1.it
telefono: 0649910913
edificio: CU027
stanza: T1A




supervisore: Alessandro Paiardini
relatore: Alessandro Paiardini

Ricerca: Sviluppo di una piattaforma per la modellazione di proteine ​​e la progettazione di farmaci all'interno dell'ambiente di visualizzazione molecolare PyMOL.

FORMAZIONE


Novembre 2021

Dottorato in Scienze della Vita - (XXXVII)
Curriculum: Bioinformatica e Omiche, Struttura e funzione delle macromolecole, Scoperta di nuovi farmaci.


Ottobre 2019 – Giugno 2021

Laurea Magistrale in Genetica e Biologia Molecolare (curriculum in inglese, LM-6) - Percorso di eccellenza - “Università degli studi di Roma La Sapienza” - 110/110 con lode

Titolo della tesi: Design and Development of a Versatile Graphical User Interface for Assisting Molecular Docking and Drug Discovery.


Ottobre 2016 – Ottobre 2019

Laurea Triennale in Biotecnologie (L-2) - “Università degli studi di Roma La Sapienza” - 110/110 con lode

Titolo tesi: Inibitori di Aurora-A: analisi del contributo della flessibilità dei residui del sito attivo nell'accuratezza del Docking molecolare



CAPACITÀ E COMPETENZE TECNICHE

- Programmazione orientata agli oggetti in Python (sviluppo software e GUI)

- Utilizzo avanzato di strumenti computazionali per la visualizzazione e la manipolazione molecolare (PyMOL, MarvinSketch, Openbabel, RDKit)

- Approfondita conoscenza teorica e pratica degli algoritmi di docking molecolare e dei relativi programmi

- Analisi bioinformatiche su dati derivati ​​dalla spettrometria di massa.

- Utilizzo e gestione dei Sistemi Operativi Linux, macOS e Windows (aggiornamenti software, installazione programmi)

- Buon livello di conoscenza dei linguaggi di programmazione Bash e R

- Previsione della struttura proteica (Costruzione di modelli per omologia)

Produzione scientifica

  • 11573/1691811 - 2023 - PyPCN: protein contact networks in PyMOL (01a Articolo in rivista)
    SERENA ROSIGNOLI, Luisa DI PAOLA, ALESSANDRO PAIARDINI
  • 11573/1661534 - 2022 - Boosting the full potential of PyMOL with structural biology plugins (01g Articolo di rassegna (Review))
    SERENA ROSIGNOLI, ALESSANDRO PAIARDINI
  • 11573/1625113 - 2022 - Prediction and modeling of protein–protein interactions using “Spotted” peptides with a template-based approach (01a Articolo in rivista)
    Chiara Gasbarri, SERENA ROSIGNOLI, GIACOMO JANSON, DALILA BOI, ALESSANDRO PAIARDINI
  • 11573/1662673 - 2022 - Severe Bartter syndrome type 1: Prompt postnatal management thanks to antenatal identification of SLC12A1 pathogenic variants (01a Articolo in rivista)
    DANIELA D'ANGELANTONIO, SILVIA MAJORE, TIZIANA DI NETTA, FEDERICA ZOTTA, GIULIA PARISE, EMANUELE SAVINO, SERENA ROSIGNOLI, BIANCA BIZZARRI, Paola GRAMMATICO, IRENE BOTTILLO
  • 11573/1655650 - 2022 - DockingPie: a consensus docking plugin for PyMOL (01a Articolo in rivista)
    SERENA ROSIGNOLI, ALESSANDRO PAIARDINI
  • 11573/1600685 - 2021 - Design and development of a versatile graphical user interface for assisting consensus docking analyses on therapeutic targets for cancer treatment. (04f Poster)
    SERENA ROSIGNOLI, ALESSANDRO PAIARDINI
  • 11573/1534289 - 2021 - The archaeal elongation factor EF-2 induces the release of aIF6 from 50S ribosomal subunit (01a Articolo in rivista)
    GIADA LO GULLO, ALESSANDRO PAIARDINI, SERENA ROSIGNOLI, Paola LONDEI, DARIO BENELLI

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