Ricerca: Interazioni non canoniche RNA-proteina
21-07-2023
Laurea magistrale in Bioinformatica presso l'Università di Roma Tor Vergata.
Voto: 110 / 110 e lode con menzione accademica da parte del Presidente di Commissione
21-10-2021
Laurea triennale in Scienze Biologiche presso l'Università di Roma Tor Vergata.
Voto: 110 / 110 e lode
Novembre 2022- Giugno 2023
Tirocinio Esterno presso Il centro di Ricerca ENEA (Casaccia) nell'ambito della Bioinformatica Strutturale.
•Titolo Tesi: "Costruzione di un modello di PM0.1 e modellazione della sua interazione con membrane biologiche raft-like e non raft-like mediante simulazioni di dinamica molecolare classica"
• Argomento Tesi: Al fine di indagare le potenziali interazioni di PM 0.1 con bersagli biologici, in particolare il suo ruolo nelle malattie neurodegenerative, è stato costruito un modello strutturale di PM 0.1 (materia particolata atmosferica), insieme a tre modelli di membrane biologiche, di cui due includevano domini di raft lipidici.
Marzo 2021-Settembre 2021
Tirocinio interno presso il Dipartimento di Citogenetica e Mutagenesi Ambientale
• Titolo Tesi: "L'ipotesi della formazione di micronuclei attraverso meccanismi non mitotici in linfociti umani in seguito all'esposizione in vitro a radiazioni elettromagnetiche: 1) radiazioni ionizzanti (raggi X) o 2) radiofrequenze (915 MHz)."
•Argomento Tesi: In questo studio, sono state confrontate le frequenze di micronuclei e gemme nucleari osservate nelle fasi interfasiche pre-mitotica e post-mitotica (cellule mononucleate e binucleate), in seguito all'esposizione in vitro a radiazioni elettromagnetiche e alla stimolazione mitogena dei linfociti. Dopo un'osservazione microscopica attenta e prolungata, i risultati hanno rivelato che le cellule trattate con radiofrequenze non hanno mostrato aumenti nelle frequenze di micronuclei e gemme, mentre con i raggi X, è stata osservata un'incremento nelle frequenze di gemme e micronuclei, anche nella fase interfasica pre-mitotica.
COMPETENZE DI BASE ACQUISITE
• Esperienza nell'utilizzo di software per analisi di RNA-seq applicate a campioni di leucemia: fastqc, fastp, cutadapt, trimmomatic, hisat2.
• Esperienza con sistemi Unix/Linux.
• Esperienza con il software Packmol: un pacchetto progettato per generare configurazioni iniziali di sistemi molecolari.
• Esperienza con CHARMM-GUI: interfaccia basata su web che fornisce un ambiente user-friendly per la costruzione e la preparazione di file di input per vari tipi di simulazioni molecolari.
• Conoscenza di linguaggi di programmazione: Python, Ruby, PHP, Bash, R, tcl.
• Conoscenza di software per simulazioni e analisi di dinamica molecolare: NAMD, GROMACS, AMBER.
• Conoscenza di software per la visualizzazione grafica: VMD, PyMol, ChimeraX.
• Conoscenza di basi di dati scientifiche: PubMed, GenBank, Pubchem, PDB, UNIPROT.
LINGUE
• Italiano (nativo)
• Inglese (competenza professionale avanzata)