Ricerca: Ruolo delle RBPs nella comunicazione cellulare mediata da vescicole extracellulari
Titolo del progetto di dottorato: "Ruolo delle RBPs nella comunicazione cellulare mediata da vescicole extracellulari"
Area tematica: Biologia applicata
SSD: BIO/13
Resume
Laurea triennale in Scienze Biologiche (Studio del ruolo del fattore trascrizionale DAG1 nel processo di germinazione di Cardamine Hirsuta)
Laurea magistrale in Genetica e Biologia Molecolare (Cardamine hirsuta, un modello vegetale ad alto potenziale germinativo: caratterizzazione del pathway di germinazione)
Breve descrizione del progetto di dottorato:
Il progetto di dottorato mira ad ampliare le conoscenze sulla comunicazione intercellulare mediata dalle vescicole extracellulari durante la progressione tumorale focalizzando l'attenzione sulle RNA binding proteins, note in letteratura per avere un ruolo nel caricamento di RNA nelle EVs. In particolare è stato analizzato il ruolo della RBP SYNCRIP nel caricamento di microRNA in EVs prodotti da cellule di epatocarcinoma, silenziando stabilmente la proteina attraverso shRNA. I microRNA contenuti all'interno delle EVs sono stati isolati e sottoposti ad NGS, mentre diversi tipi di cellule riceventi sono state trattate con le stesse vescicole per un analisi funzionale. I risultati del sequenziamento sono stati sottoposti ad analisi bioinformatica utilizzando una pipeline da me sviluppata.
Partecipazione al progetto di ricerca finanziato da AIRC
Titolo: "IMPACT OF RNA BINDING PROTEINS ON CELL-TO-CELL COMMUNICATION IN TUMOR PROGRESSION"
PI: Marco Tripodi
Grant: 500.000€
Durata: 5 anni
Seminari, meetings, corsi frequentati:
Application of deep learning to the protein structure prediction: the tale of a "gigantic leap"
(Speaker: Anna Marabotti)
Deciphering self-renewal traits in epidermal stem cells
(Speaker: Elena Enzo)
Insulin signaling in Alzheimer's disease brain and models thereof
(Speaker: Eugenio Barone)
Educating tutor-associate macrophages under metabolic stress
(Speaker: Ping-Chih Ho)
Protecting our genome: mechanisms to maintain DNA repeats stability in human cells
(Speaker: Simona Giunta)
Regulation of enzymatic activity mediated by liquid-liquid phase separation
(Speaker: Mirco Dindo)
The chaperonin GroEL nano-machine: allostery and function
(Speaker: Amnon Horowitz)
The axonal transport machinery and its dysfunctions in neurogenerative diseases
(Speaker: Giampietro Schiavo)
Advanced Microscopy
(Corso organizzato dalla prof. Silvia Di Angelantonio)
Preparing artwork for scientific papers
(Corso organizzato dal prof. Giorgio Giardina)
Riboregulation from bacteria to eukaryotes: mechanisms and challenges
(Congresso)
NanoInnovation 2023
(Congresso)