Ricerca: Il processo autofagico: ruolo dei microtubuli e dell'acetilazione della tubulina
FRANCESCA ROMANA PELLEGRINI
Titolo del progetto di ricerca: "Esplorare il ruolo dell'Alfa-tubulina N-acetiltransferasi 1 (ATAT1) nell'autofagia del cancro: dal meccanismo molecolare ai bersagli terapeutici".
Area tematica: Biologia molecolare
SSD: BIO/11
Formazione:
• 2021 - In corso: Dottorato di ricerca in Scienze della Vita presso l'Università "La Sapienza" di Roma sotto la supervisione della Dott.ssa Daniela Trisciuoglio. Attività svolta: Studio del ruolo dell'enzima ATAT1 (Alfa-tubulina N-acetiltransferasi 1) nel cancro al polmone.
• Laurea magistrale in Genetica e Biologia Molecolare, curriculum italiano (LM-06), Facoltà di Scienze Matematiche, Fisiche e Naturali dell'Università "La Sapienza" di Roma conseguita il 20.10.2021 con la votazione di 110/110 e lode, discutendo la tesi sperimentale dal titolo "Caratterizzazione di una molecola con attività antitumorale: meccanismi cellulari che promuovono l'autofagia e loro ruolo nella morte cellulare". Relatore: Dott.ssa Francesca Degrassi
• Laurea triennale in Scienze Biologiche, presso l'Università "La Sapienza" di Roma conseguita il 21/03/2019 con votazione 95/110, discutendo la tesi compilativa dal titolo "Tecniche di crioconservazione di ovociti ed embrioni: implicazioni nelle tecniche di riproduzione assistita". Relatore esterno: Veronica Corsetti; relatore interno: Prof.ssa Ada Maria Tata
• Diploma di maturità classica, conseguito nel 2015 presso il Liceo Classico "Dante Alighieri" di Roma (RM).
Esperienza professionale e di ricerca:
• Giugno 2021 - in corso: Borsa di studio presso l'Istituto di Biologia e Patologia Molecolare (IBPM) del CNR, su un progetto dal titolo "Exploring the role of Alpha-tubulin N-acetyltransferase 1 in cancer: from molecular mechanisms to therapeutic targets" - finanziato da AIRC (Associazione Italiana per la Ricerca sul Cancro) - cod. IG 2020 #24942 - responsabile scientifico e titolare del finanziamento Dott.ssa Daniela Trisciuoglio.
• Contratto di collaborazione occasionale presso l'Istituto di Biologia Molecolare e Patologia (IBPM) del CNR, su un progetto dal titolo "Dynamic signaling reciprocity shapes invadopodia function and metastatic process of ovarian cancer: role of endothelin-1" - finanziato da AIRC (Associazione Italiana per la Ricerca sul Cancro) - cod. IG 2018 Id. 21372 3° anno 2021 - responsabile scientifico e titolare del finanziamento Dott.ssa Laura Rosanò. AVVISO N. 4/2021. Attività svolta: partecipazione a procedure sperimentali basate sull'utilizzo di colture cellulari primarie ovariche, microscopia a fluorescenza e citofluorimetria per l'analisi dell'espressione e dell'attivazione di proteine del citoscheletro in relazione all'interazione dei segnali tra recettore dell'endotelina e integrina beta1 nel processo metastatico del carcinoma ovarico.
• Settembre 2020 - Ottobre 2021: Tirocinio formativo per la preparazione della tesi sperimentale in Genetica e Biologia Molecolare presso l'Istituto di Biologia e Patologia Molecolare (IBPM) del CNR, Roma, nel laboratorio della dott.ssa Francesca Degrassi. Attività svolta: Studio di piccole molecole con possibile attività antitumorale, che inducono la morte cellulare inibendo la corretta fusione tra autofagosomi e lisosomi con conseguente blocco del flusso autofagico.
Breve descrizione del progetto di dottorato:
Un numero crescente di prove suggerisce che la dinamica del citoscheletro di actina e i microtubuli svolgono un ruolo chiave nell'autofagia. L'autofagia è un meccanismo altamente conservato in tutti gli eucarioti, utilizzato per degradare e riciclare vari costituenti cellulari. Negli ultimi anni è stato scoperto un coinvolgimento diretto delle modificazioni post-traduzionali della tubulina, tra cui la tirosinazione e l'acetilazione, nella regolazione del processo autofagico. Tuttavia, il ruolo dell'enzima ATAT1, responsabile dell'acetilazione della tubulina sul residuo di lisina 40 della catena alfa della tubulina, in questo campo è ancora del tutto inesplorato. Questo progetto si propone di indagare il ruolo di ATAT1 nel processo autofagico e come il suo coinvolgimento possa influenzare la progressione e l'aggressività dei tumori.
Abstract e partecipazioni a conferenze
• Francesca Romana Pellegrini, A. Iuzzolino, F. Ambrosio, M. Pierrettori, A. Paone, S. Rinaldo, F. Crutruzzolà, F. Degrassi, V. Stagni, D. Trisciuoglio. ATAT1, α-Tubulin N-acetyltransferase 1, promotes autophagy and oxidative stress in non-small cell lung cancer cell lines. The Biennial Congress of the Italian Association of Cell Biology and Differentiation, ABCD 2023. POSTER
• Pellegrini FR, Fianco G, De Martino S, Ventura I, Valente D, Fiore M, Trisciuoglio D, Degrassi F. Blockage of autophagosome-lysosome fusion through SNAP29 inhibition promotes apoptosis in cancer cells. 62nd annual Meeting of the Italian Cancer Society Venice, November 16-18, 2022. POSTER
• Pellegrini FR, De Martino S, Ventura I, Fiore M, Trisciuoglio D, Degrassi F. Blockage of autophagosome-lysosome fusion through SNAP29 inhibition promotes apoptosis via ROS production. 2021 CNR-DSB Conference on “Target discovery for unmet medical needs and precision/ personalized medicine” nella sessione Targets identification in oncology. POSTER
Corsi frequentati:
• June 2021 - July 2021: Online training course "Seeing is believing: school of microscopy - Researcher's Edition" Fondazione Golinelli"
• Technical innovations in basic and translational research: applications to immunology-oncology – 11/2021
• Preparing artworks for scientific papers PhD Course – 05/2022
• Bioinformatic course PhD Life Sciences 01/2023
• Microscopy course PhD Life Sciences 01/2023
• Microscopy course PhD Genetics and Molecular Biology “Imaging 3D cellular models for biomedical applications” 10/2023
Altri prodotti della ricerca:
- Pipeline CellProfiler pubblicata online (https://cellprofiler.org/published-pipelines#:~:text=CellProfiler%20abilita%20la%20ricerca%20riproducibile%20perché,CellProfiler%20usato%20per%20crearla%20).
Elenco delle pubblicazioni:
• Fiorentino F; Sementilli S; Menna M; Turrisi F; Tomassi S; Pellegrin FR; Iuzzolino A; D'Acunzo F; Feoli A; Wapenaar H; Taraglio S; Fraschetti C; Del Bufalo D; Sbardella G; Dekker F; Paiardini A; Trisciuoglio D; Mai A; Rotili D. "First-in-Class Selective Inhibitors of the Lysine Acetyltransferase KAT8" Journal of Medicinal Chemistry. Accepted manuscript (Manuscript ID: jm-2022-01937g.R1)
• Pellegrini FR, De Martino S, Fianco G, Ventura I, Valente D, Fiore M, Trisciuoglio D, Degrassi F. Blockage of autophagosome-lysosome fusion through SNAP29 O-GlcNAcylation promotes apoptosis via ROS production. Autophagy. 2023;1-16. doi:10.1080/15548627.2023.2170962
• Nowak RP, Tumber A, Hendrix E, Ansari MSZ, Sabatino M, Antonini L, Andrijes R, Salah E, Mautone N, Pellegrini FR, Simelis K, Kawamura A, Johansson C, Passeri D, Pellicciari R, Ciogli A, Del Bufalo D, Ragno R, Coleman ML, Trisciuoglio D, Mai A, Oppermann U, Schofield CJ, Rotili D. First-in-Class Inhibitors of the Ribosomal Oxygenase MINA53. J Med Chem. 2021 Dec 9;64(23):17031-17050. doi: 10.1021/acs.jmedchem.1c00605. Epub 2021 Nov 29. PMID: 34843649; PMCID: PMC8667043.