Area offerta formativa e diritto allo studio | Settore Dottorato di Ricerca
TECNOLOGIE BIOMEDICHE INNOVATIVE IN MEDICINA CLINICA
INNOVATIVE BIOMEDICAL TECHNOLOGIES IN CLINICAL MEDICINE
Obiettivi formativi del dottorato
Educational goals and objectives
descrizione:
Il dottorato in Tecnologie Biomediche Innovative in Medicina Clinica si propone di realizzare un programma di addestramento alla ricerca traslazionale, attraverso l’utilizzo di biotecnologie avanzate, la gestione e analisi di grande mole di dati (Big Data Analysis) con strumenti innovativi di bioinformatica e network analysis (Network Medicine). L’obiettivo è creare un profilo di ricercatore con solide conoscenze di base, capace di selezionare e applicare le tecnologie più innovative alla comprensione della fisiopatologia di specifici quadri clinici e all’individuazione di nuove applicazioni in campo diagnostico, prognostico e terapeutico.
Specifiche finalità del dottorato:
a) rispondere alla domanda di nuovi modelli di formazione nella medicina traslazionale;
b) creare una figura professionale in campo biomedico e tecnologico in grado di fondere la competenza nell’utilizzo di tecnologie avanzate con le competenze cliniche e biologiche.
Specifici obiettivi formativi del Dottorato
a) apprendimento delle metodologie di studio del genoma e della sua variabilità [analisi di SNPs e CNV; analisi della metilazione del DNA; studio del microbioma; tecniche di next generation sequencing (NGS)] e delle metodologie bioinformatiche della per la valutazione dei risultati della ricerca genetica [disegno e analisi di studi d’associazione genome-wide e di studi NGS
b) apprendimento delle metodiche di studio dell’espressione genica [arrays; digital-PCR; RNA-seq, miRNA-seq]
c) apprendimento delle tecniche di coltura cellulare, d’isolamento, caratterizzazione e coltura di cellule progenitrici, staminali e iPS; colture di organoidi
d) apprendimento delle tecniche per lo studio in vitro ed ex vivo delle cellule dell’immunità innata e adattiva
e) apprendimento delle principali metodiche di generazione di animali geneticamente modificati costitutivi e condizionali [transgenici; knock-out; knock-in, CRISPR–Cas9]
f) apprendimento delle tecniche di proteomica e metabolomica per l’identificazione di marcatori predittivi di malattia
g) apprendimento dei principi e delle applicazioni della network medicine
h) apprendimento dei principi e delle applicazioni della BigData Science
i) progettazione e implementazione di algoritmi predittivi (machine learning) per analizzare ed estrarre conoscenze utili dai dati medici disponibili sotto forma di reti (biologiche e sociali), sequenze (traiettorie dei pazienti), e dati non strutturati (testo, immagini)
l) apprendimento delle basi della sperimentazione clinica, gestioni dei dati sperimentali, pubblicazione e interpretazione dei risultati
m) apprendimento delle basi della sperimentazione clinica in silico
n) valutazione degli aspetti imprenditoriali e industriali delle biotecnologie avanzate
PhD:
INNOVATIVE BIOMEDICAL TECHNOLOGIES IN CLINICAL MEDICINE
description:
The PhD course in Innovative Biomedical Technologies in Clinical Medicine is designed to carry out a training program in translational medicine by using advanced biotechnologies, and improving the ability to manage and analyze large amount of data (Big Data Analysis) through innovative bioinformatics and computer science tools (Network Medicine). of the goal is promoting a new profile of researcher with specific skills not only for using innovative technologies for the investigation of molecular mechanisms of diseases but also for applying the results of this investigation to the diagnosis, prognosis and therapy of specific clinical conditions.
Main purposes of the doctorate:
a) to respond to increased demand for new models of teaching aimed at preparing to the so-called translational medicine
b) to create professionals who are expert in translational and network medicine, able to combine the expertise in the use of advanced information and communication technologies with the clinical skills necessary to identify relevant scientific issues as well as potential applications of new findings.
Specific educational objectives:
a) to learn the most advanced methodologies to study genome and its variability (genomic analysis of SNPs and CNV; techniques for DNA methylation analysis; microbial study; next-generation sequencing (NGS) techniques] and bioinformatics methodologies underlying the evaluation of genetic research results [design and analysis of genome-wide association studies and NGS studies;
b) to learn the methods for gene expression analysis [arrays; digital-PCR; RNA-seq; miRNA-seq]
c) to learn cell culture techniques, including the isolation, characterization and culturing of progenitor cells, stem cells and iPS; organoid cultures
d) to learn techniques for in vitro and ex vivo cells of innate and adaptive immunity
e) to learn the main techniques for genetic manipulation and conditioning [transgenic; knock-out; Knock-in; CRISPR–Cas9 technology]
f) to learn proteomic and metabolomic techniques for identifying disease predictors
g) learning the principles and applications of network medicine
h) to apprehend the principles and applications of BigData Science
i) to design and implement predictive algorithms (machine learning) to analyze and extract useful knowledge from the large variety and dimension of available medical data, both in the form of networks (biological and social), sequences (patients’ trajectories), and unstructured data (text and images)
l) to learn the basics of clinical trials, experimental data management as well as publication and interpretation of results
m) to learn the basics of in silico clinical trials
n) to understand the business and industrial aspects related to advanced biotechnology.
Borse e posti di dottorato disponibili
Available scholarships and positions
Tipologia 1: ex D.M. 630/2024
Tipologia 2: ex D.M. 629/2024
Tipologia 3: PE/PNC/CN/TP
Tipologia 4: Enti terzi e Eccellenza
Tipologia 5: Sapienza
Posti senza borsa
Transizione digitale
Generiche
Pubblica Amministrazione
Patrimonio culturale
PE/PNC
CN/TP
Enti terzi
Eccellenza
0
0
0
5
0
Tematiche, curriculum e competenze specifiche
Themes, curriculum and specific skills
PNRR351 CN - non associata a curriculum
- CN3, Centro Nazionale di Ricerca Sviluppo di terapia genica e farmaci con tecnologia a RNA, Spoke 9 - Immunoreactivity efficacy and biosafety Validation of therapeutic value of post-stroke RNAs
Competenze richieste:
nessuna competenza specifica richiesta
- CN3, Centro Nazionale di Ricerca Sviluppo di terapia genica e farmaci con tecnologia a RNA, Spoke 9 - Immunoreactivity efficacy and biosafety Validation of therapeutic value of post-stroke RNAs
Required skills:
no specific skill required
Il candidato sceglierà una o più tematiche in fase di presentazione della candidatura on line
Valutazione titoli
Qualifications assessment
lingua/
language
:
ITALIANO
I titoli sottoposti a valutazione saranno:
1. Breve curriculum vitae che riporta in particolare il titolo della tesi di laurea o di specializzazione, la frequenza di corsi postlaurea, e le precedenti esperienze di ricerca in Italia e/o all’estero comprensivo della lista delle pubblicazioni (inclusi le presentazioni a congressi), se presenti.
2. Progetto di ricerca. Ai fini della selezione per il dottorato di ricerca, il candidato dovrà presentare un progetto che possa far valutare la propensione del candidato alla ricerca e la sua capacità di progettare e organizzare in autonomia le diverse fasi del progetto. Il progetto non dovrà superare la lunghezza massima di 8000 caratteri (spazi inclusi). Il progetto presentato ai fini concorsuali non costituisce obbligo, per i candidati ammessi, nello svolgimento dell’attività di ricerca nel corso del dottorato
The evaluation of the candidate's qualification will be based on:
1. Short curriculum vitae that includes, in particular, the title of the thesis or specialization, the degree of postgraduate courses, and the previous research experience in Italy and / or
abroad, including the list of publications (including meeting presentations).
2. Research project. For the purpose of selection for the PhD, the candidate must submit a project that can assess the applicant's propensity for the research and its ability to independently design and organize the various phases of the project. The project must not
exceed the maximum length of 8000 characters (spaces included).
The project presented for competition purposes is not an obligation for the candidates admitted to carrying out the research activity during the PhD course.
Prova scritta
Written examination
lingua/
language
:
ITALIANO
Il candidato dovrà svolgere un tema su un argomento estratto a sorte tra 3 proposti
dalla Commissione. Gli argomenti saranno scelti tra le seguenti tematiche:
1. La medicina di precisione (aspetti genetici ed epigenetici)
2. Le basi genetiche ed epigenetiche della patologia oncologica
3. I meccanismi immunologici delle malattie croniche del bambino e dell’adulto
4. Aspetti clinico diagnostici delle malattie del metabolismo
5. I marcatori genetici e biochimici del rischio cardiovascolare
6. Le metodiche di imaging in vivo e loro applicazioni alle patologie cardiovascolari e
neoplastiche
7. Le metodologie di studio del genoma e della sua variabilità [analisi a livello
Genomico di SNPs e CNV; tecniche di analisi della metilazione del DNA; studio del
microbioma; tecniche next generation sequencing per il sequenziamento del genoma e/o dell’esoma]
8. Approcci diagnostici e terapeutici innovativi (cellule staminali, microRNA, terapie molecolari) applicati alle patologie oncologiche, cardiovascolari, infiammatorie e endocrinologiche)
9. Le metodologie di studio delle patologie a genetica complessa
10. Metodologie di studio della fisiopatologia metabolica (utilizzo in viso di traccianti non isotopici, clamp euglicemico-iperinsulinemico, valutazione del dispendio energetico e del metabolismo basale, composizione corporea).
11. L’utilizzo di database informatizzati per la valutazione di esiti clinici nel modo reale: l’approccio ai bigdata
Per lo svolgimento del tema il candidato avrà a disposizione al massimo 4 ore
La prova sarà svolta in: ITALIANO
The candidate must write a short essay on 1 topic selected by lot among 3 proposed by the
Committee The topic of written test will be selected among the following subjects:
1. Precision medicine (genetic and epigenetic aspects)
2. The genetic and epigenetic bases of oncology pathology
3. Immunological mechanisms of chronic childhood and adult illnesses
4. Clinical-diagnostic aspects of metabolic diseases
5. The genetic and biochemical markers of cardiovascular risk
6. In vivo imaging methods and their applications in cardiovascular and neoplastic diseases
7. The methodologies for studying genome and its variability (genomic analysis of SNPs and CNV; DNA methylation analysis techniques; Next Generation Sequencing]
8. Innovative diagnostic and therapeutic approaches (stem cells, microRNAs, molecular therapies) applied to oncological, cardiovascular, inflammatory and endocrinological pathologies
9. Methodologies for studying complex genetic disorders
10. Methods for investigating metabolic pathophysiology (use in the face of non-isotopic tracers, hyperinsulinemic-euglycemic clamp, energy expenditure and baseline metabolism, body composition).
11. The use of computerized databases for the evaluation of clinical outcomes in the real world: the approach to the bigdata.
The time available to complete the essay is 4 hours
The test will be taken in Italian
Prova orale
Oral interview
lingua/
language
:
ITALIANO
La prova orale si baserà su:
1. Discussione del contenuto della prova scritta
2. Valutazione delle precedenti esperienze di ricerca del candidato con eventuale discussione delle pubblicazioni se riportate
3. Discussione della proposta di progetto di ricerca
4. Test di conoscenza della lingua inglese
The interview will be based on the following topics:
1. Discussion of the contents of the written test
2. Evaluation of candidate previous research experience with reviewing of
publications if reported
3. Discussion of the research proposal
4. Test of knowledge of English language
Informazioni e recapiti
contacts and info
https://phd.uniroma1.it/web/TECNOLOGIE-BIOMEDICHE-INNOVATIVEIN-MEDICINA-CLINICA_nD3551_IT.aspx Dipartimento di Medicina Traslazionale e di Precisione Indirizzo di posta elettronica: mariaconcetta.maiorano@uniroma1.it Tel. +39 0649974522
Eventuali ulteriori informazioni
more info
Segreteria: Dipartimento di Medicina Traslazionale e di Precisione - Sig.ra MARIA CONCETTA MAIORANO
https://phd.uniroma1.it/web/TECNOLOGIE-BIOMEDICHE-INNOVATIVEIN-MEDICINA-CLINICA_nD3551_IT.aspx
Department of Translational and Precision Medicine
email: mariaconcetta.maiorano@uniroma1.it Phone +39 0649974522
Curriculum studiorum
- data e voto di laurea (obbligatorio)
Graduation date and grade of the Master's degree
- elenco degli esami sostenuti per la laurea
MAGISTRALE
e relative votazioni (obbligatorio)
detailed list of exams including completion dates and scores of Masters's degree
- elenco degli esami sostenuti per la laurea
TRIENNALE
e relative votazioni
Graduation date and grade of the Bachelor's degree
- data e voto della laurea
TRIENNALE
detailed list of exams including completion dates and scores of Bachelor's degree
- elenco cronologico di Borse di studio, Assegni di ricerca (et similia) percepiti
History of Scholarships, Research Grants (or similar)
- Diplomi/certificati di conoscenza lingue estere
Certificates of Foreign Languages
- Diplomi/attestati di partecipazione di corsi universitari post-lauream
Certificates of participation in post-graduate university courses
- Attestati di partecipazione a gruppi di ricerca
certificates of Participation in research groups
- Attestati di partecipazione a stage
certificates of Participation in internships
- Altri riconoscimenti (p. es.: premiazione in concorsi, seconda laurea)
Other University Awards/Degrees (e.g.: awards in competition, second degree)
- Conoscenze informatiche
computer skills
Ulteriore documentazione richiesta ai candidati
Additional documentation required
progetto di ricerca (research project)
non obbligatorio/
optional
, da caricare entro 25/08/2022
elenco delle pubblicazioni
non obbligatorio/
optional
, da caricare entro 25/08/2022
Curriculum Vitae et Studiorum
non obbligatorio/
optional
, da caricare entro 25/08/2022
Competenza linguistica richiesta ai candidati
Language Skills
Il candidato dovrà obbligatoriamente conoscere le seguenti lingue:
the candidate will have to know the following languages
INGLESE
Diario delle prove concorsuali
Exam Schedule
Valutazione titoli
Qualifications assessment
giorno/
day
08/09/2022
note/
notes
nessuna
pubblicazione sull'albo/
publication on notice board
SI
pubblicazione sul sito internet/
publication on the web site
SI
indirizzo del sito/
web site
https://phd.uniroma1.it/web/TECNOLOGIE-BIOMEDICHE-INNOVATIVEIN- MEDICINA-CLINICA_nD3551_IT.aspx
giorno della pubblicazione/
date of publication
09/09/2022
info e recapiti/
contacts
mariaconcetta.maiorano@uniroma1.it
Prova scritta
Written examination
giorno/
day
14/09/2022
note/
notes
nessuna
ora/
time
09:00
aula/
classroom
da definire
indirizzo/
address
da definire
pubblicazione sull'albo/
publication on notice board
SI
pubblicazione sul sito internet/
publication on the web site
SI
indirizzo del sito/
web site
https://phd.uniroma1.it/web/TECNOLOGIE-BIOMEDICHE-INNOVATIVEIN- MEDICINA-CLINICA_nD3551_IT.aspx
giorno della pubblicazione/
date of publication
17/09/2022
info e recapiti/
contacts
mariaconcetta.maiorano@uniroma1.it
Prova orale
Oral interview
giorno/
day
19/09/2022
note/
notes
nessuna
ora/
time
09:00
aula/
classroom
da definire
indirizzo/
address
da definire
pubblicazione sull'albo/
publication on notice board
SI
pubblicazione sul sito internet/
publication on the web site
SI
indirizzo del sito/
web site
https://phd.uniroma1.it/web/TECNOLOGIE-BIOMEDICHE-INNOVATIVEIN- MEDICINA-CLINICA_nD3551_IT.aspx
giorno della pubblicazione/
date of publication
20/09/2022
info e recapiti/
contacts
mariaconcetta.maiorano@uniroma1.it
Griglie di valutazione
Evaluation scale
Valutazione titoli
Qualifications assessment
FILE NON CARICATO
FILE NON CARICATO
Prova scritta
Written examination
FILE NON CARICATO
FILE NON CARICATO
Prova orale
Oral interview
FILE NON CARICATO
FILE NON CARICATO